short stature homeobox 2

同義遺伝子名

Short stature homeobox protein 2, Paired-related homeobox protein SHOT, SHOX2, Homeobox protein Og12X, short stature homeobox 2, OG12, SHOT, OGI2X, OG12X

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:1.20

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:5.90

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

GeneChip

大脳:3.90

小脳:3.36

脳幹:3.40

脳梁:3.46

松果体:-

末梢神経:5.32

脊柱:3.26

網膜:-

目:-

動脈:3.54

静脈:6.04

リンパ節:4.05

末梢血:-

脾臓:3.18

胸腺:3.13

骨髄:3.36

脂肪:4.03

骨:-

皮膚:3.65

CAGE

大脳:0.20

小脳:-

脳幹:0.30

脳梁:1.11

松果体:2.48

末梢神経:-

脊柱:0.32

網膜:-

目:-

動脈:1.03

静脈:0.88

リンパ節:0.35

末梢血:-

脾臓:0.09

胸腺:0

骨髄:-

脂肪:1.99

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.69

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:1.30

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:1.70

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:-

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:3.56

胎盤:3.34

前立腺:3.13

卵巣:3.42

精巣:4.54

心臓:3.80

骨格筋:3.76

食道:3.57

胃:3.34

腸:3.36

結腸:3.50

肝臓:3.44

肺:3.33

膀胱:-

腎臓:3.37

下垂体:3.55

甲状腺:3.33

副腎:3.30

膵臓:3.52

乳腺:4.11

唾液腺:3.52

CAGE

子宮:1.39

胎盤:0.54

前立腺:0.66

卵巣:0.47

精巣:0.76

心臓:1.16

骨格筋:0.89

食道:0.90

胃:-

腸:0.07

結腸:0.18

肝臓:0

肺:0.42

膀胱:0.69

腎臓:0.08

下垂体:0.34

甲状腺:0.32

副腎:-

膵臓:0.94

乳腺:2.34

唾液腺:0.36

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.88

卵巣:0.08

精巣:0.72

心臓:0.14

骨格筋:0.62

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.18

肝臓:0

肺:0.10

膀胱:-

腎臓:0.11

下垂体:-

甲状腺:0.31

副腎:0.22

膵臓:-

乳腺:1.47

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001163678
Gene ID	6474
Unigene ID	Hs.559677
Probe set ID	208443_x_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000258518
GTEx ID	ENSG00000258518

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_013665
ラット [0]

染色体

3q25.32 [157,815,816 - 157,823,813]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

3q25.32 [157,813,743 - 157,824,292]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001356	Homeobox
IPR009057	Homeodomain-like
IPR012287	Homeodomain-related

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0007507	heart development
GO:0007399	nervous system development
GO:0001501	skeletal system development

Cellular Component

GO:0005634

nucleus

Molecular Function

GO:0003700

transcription factor activity

short stature homeobox 2

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function