UPF3 regulator of nonsense transcripts homolog B (yeast)

同義遺伝子名

UPF3X, RENT3B, hUpf3p-X, UPF3B, Nonsense mRNA reducing factor 3B, Up-frameshift suppressor 3 homolog B, Regulator of nonsense transcripts 3B, hUpf3B, HUPF3B

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:10.70

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:118.60

目:5.90

動脈:30

静脈:-

リンパ節:20.20

末梢血:18.20

脾臓:37.80

胸腺:38.70

骨髄:39.40

脂肪:-

骨:-

皮膚:19.20

GeneChip

大脳:6.39

小脳:7.12

脳幹:6.57

脳梁:6.67

松果体:-

末梢神経:6.43

脊柱:6.44

網膜:-

目:-

動脈:6.66

静脈:5.90

リンパ節:6.85

末梢血:-

脾臓:6.79

胸腺:7.58

骨髄:6.56

脂肪:6.10

骨:-

皮膚:6.29

CAGE

大脳:2.83

小脳:-

脳幹:2.93

脳梁:2.43

松果体:3.46

末梢神経:-

脊柱:3.18

網膜:-

目:-

動脈:2.08

静脈:2.37

リンパ節:2.31

末梢血:-

脾臓:2.39

胸腺:2.30

骨髄:-

脂肪:2.05

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:2.74

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:2.89

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:2.32

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:18.20

胎盤:10.90

前立腺:33.80

卵巣:37.30

精巣:21.60

心臓:12.80

骨格筋:20.10

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:42.40

肝臓:52.80

肺:9.80

膀胱:-

腎臓:10.40

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:18.60

唾液腺:-

GeneChip

子宮:6.95

胎盤:6.06

前立腺:6.66

卵巣:6.60

精巣:5.33

心臓:5.61

骨格筋:5.86

食道:6.64

胃:6.22

腸:5.58

結腸:5.44

肝臓:6.09

肺:6.52

膀胱:-

腎臓:5.76

下垂体:6.99

甲状腺:6.89

副腎:6.06

膵臓:4.35

乳腺:5.95

唾液腺:5.83

CAGE

子宮:2.64

胎盤:2.07

前立腺:2.70

卵巣:2.26

精巣:2.44

心臓:2.07

骨格筋:2.58

食道:2.48

胃:-

腸:2.53

結腸:2.49

肝臓:2.45

肺:2.28

膀胱:2.68

腎臓:2.29

下垂体:3.05

甲状腺:2.39

副腎:-

膵臓:1.74

乳腺:2.27

唾液腺:1.75

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:3.05

卵巣:2.49

精巣:3.55

心臓:1.59

骨格筋:2.13

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:3.29

肝臓:2.11

肺:2.47

膀胱:-

腎臓:2.90

下垂体:-

甲状腺:2.17

副腎:2.73

膵臓:-

乳腺:2.09

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_023010
Gene ID	65109
Unigene ID	Hs.103832
Probe set ID	218757_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000125351
GTEx ID	ENSG00000125351

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_026573
ラット[1]	NM_001135873

染色体

Xq24 [118,967,985 - 118,986,961]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0010467	gene expression
GO:0031124	mRNA 3'-end processing
GO:0006406	mRNA export from nucleus
GO:0016071	mRNA metabolic process
GO:0000398	nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0000184	nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
GO:0045727	positive regulation of translation
GO:0016070	RNA metabolic process
GO:0008380	RNA splicing
GO:0006369	termination of RNA polymerase II transcription
GO:0006366	transcription from RNA polymerase II promoter

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0005829	cytosol
GO:0035145	exon-exon junction complex
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0003729	mRNA binding
GO:0005487	nucleocytoplasmic transporter activity
GO:0000166	nucleotide binding
GO:0005515	protein binding

UPF3 regulator of nonsense transcripts homolog B (yeast)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function