solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, betaine/GABA), member 12

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同義遺伝子名

FLJ38727, Sodium- and chloride-dependent betaine transporter, SLC6A12, Na+/Cl-betaine/GABA transporter, BGT-1, BGT1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:47.40 小脳:75.60 脳幹:- 脳梁:87.50 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:5.90 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:36.40 脾臓:- 胸腺:12.90 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
GeneChip 大脳:6.06 小脳:5.37 脳幹:6.14 脳梁:5.59 松果体:- 末梢神経:5.20 脊柱:5.63 網膜:- 目:- 動脈:4.84 静脈:4.71 リンパ節:4.71 末梢血:- 脾臓:4.62 胸腺:4.37 骨髄:4.89 脂肪:4.96 骨:- 皮膚:4.92
CAGE 大脳:1.79 小脳:- 脳幹:2.28 脳梁:2.08 松果体:1.03 末梢神経:- 脊柱:1.22 網膜:- 目:- 動脈:0.34 静脈:0.18 リンパ節:0.03 末梢血:- 脾臓:0.88 胸腺:0.06 骨髄:- 脂肪:0.96 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.78 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.06 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.20 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:14.60 前立腺:- 卵巣:- 精巣:8.70 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:31.70        肺:4.90    膀胱:- 腎臓:166.40 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:4.61 胎盤:4.92 前立腺:4.70 卵巣:4.86 精巣:5.12 心臓:4.82 骨格筋:5.12 食道:4.71 胃:4.77 腸:4.87 結腸:5.16 肝臓:7.08 肺:4.87 膀胱:- 腎臓:7.80 下垂体:5.12 甲状腺:5.06 副腎:5.27 膵臓:5.29 乳腺:4.58 唾液腺:4.89
CAGE 子宮:0.04 胎盤:0.81 前立腺:0 卵巣:0.32 精巣:0.10 心臓:0.07 骨格筋:0.05 食道:0 胃:- 腸:1.10 結腸:0.51     肝臓:3.00    肺:0.84 膀胱:0.09 腎臓:3.42 下垂体:0.24 甲状腺:2.01 副腎:- 膵臓:0 乳腺:0.55 唾液腺:0.36
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.46 卵巣:0.37 精巣:0.82 心臓:0.02 骨格筋:0.07 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.19     肝臓:3.64        肺:0.46    膀胱:- 腎臓:3.70 下垂体:- 甲状腺:2.71 副腎:0.21 膵臓:- 乳腺:0.10 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001122847
Gene ID 6539
Unigene ID Hs.437174
Probe set ID 206058_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000111181
GTEx ID ENSG00000111181

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_133661
ラット [0]  

染色体

12p13.33  [299,243  -  323,736]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000175  Sodium:neurotransmitter symporter
IPR002983  Sodium:neurotransmitter symporter, betaine

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

7589472
7861179
10228153
12111824
12477932
14702039
15123239
16198020
16344560
18195088
19086053
19204726
20383146
20424473
20597903
21367462
22405821
23378610

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006865  amino acid transport
GO:0071474  cellular hyperosmotic response
GO:0009992  cellular water homeostasis
GO:0006811  ion transport
GO:0007269  neurotransmitter secretion
GO:0010033  response to organic substance
GO:0007268  synaptic transmission
GO:0055085  transmembrane transport
GO:0006810  transport

Cellular Component

GO:0016021  integral to membrane
GO:0005887  integral to plasma membrane
GO:0005886  plasma membrane

Molecular Function

GO:0005332  gamma-aminobutyric acid:sodium symporter activity
GO:0005328  neurotransmitter:sodium symporter activity