solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, GABA), member 13

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同義遺伝子名

GAT2, SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, GAT-2

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:55.70 小脳:37.80 脳幹:- 脳梁:29.20 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:118.60 目:105.80 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:4.80
GeneChip 大脳:6.32 小脳:6.17 脳幹:6.38 脳梁:6.13 松果体:- 末梢神経:6.24 脊柱:6.38 網膜:- 目:- 動脈:6.21 静脈:6.29 リンパ節:6.14 末梢血:- 脾臓:5.88 胸腺:5.75 骨髄:6.39 脂肪:6.23 骨:- 皮膚:5.98
CAGE 大脳:1.85 小脳:- 脳幹:2.34 脳梁:2.21 松果体:2.54 末梢神経:- 脊柱:2.12 網膜:- 目:- 動脈:0.34 静脈:0 リンパ節:0 末梢血:- 脾臓:0 胸腺:0 骨髄:- 脂肪:0 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.62 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.00 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:11.30 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:21.10        肺:4.90    膀胱:- 腎臓:696.60 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:5.84 胎盤:6.03 前立腺:5.82 卵巣:5.87 精巣:6.04 心臓:6.29 骨格筋:6.42 食道:6.07 胃:6.16 腸:6.32 結腸:6.55 肝臓:6.64 肺:6.28 膀胱:- 腎臓:7.54 下垂体:6.20 甲状腺:6.02 副腎:6.05 膵臓:6.55 乳腺:5.77 唾液腺:6.30
CAGE 子宮:0 胎盤:0.08 前立腺:0 卵巣:0.37 精巣:0.04 心臓:0 骨格筋:0.05 食道:0 胃:- 腸:0.43 結腸:0.38     肝臓:1.44    肺:0.64 膀胱:0 腎臓:4.54 下垂体:1.34 甲状腺:2.73 副腎:- 膵臓:0 乳腺:0 唾液腺:0
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.00 卵巣:0.11 精巣:0.07 心臓:0.00 骨格筋:0.00 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0     肝臓:0.00        肺:0.13    膀胱:- 腎臓:3.29 下垂体:- 甲状腺:1.18 副腎:0.00 膵臓:- 乳腺:0.00 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_016615
Gene ID 6540
Unigene ID Hs.504398
Probe set ID 207184_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000010379
GTEx ID ENSG00000010379

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_144512
ラット [0]  

染色体

12p13.33  [329,789  -  372,039]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000175  Sodium:neurotransmitter symporter
IPR002981  Sodium:neurotransmitter symporter, GABA, GAT-2

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1400419
8889548
11824941
12477932
15252450
16125675
16344560
17502375
19056867
19086053
19450549
19874574
19913121
20379614
20383146
20398908
20424473
20628086
22932902
23275563
23378610

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007269  neurotransmitter secretion
GO:0007268  synaptic transmission
GO:0055085  transmembrane transport

Cellular Component

GO:0005887  integral to plasma membrane
GO:0005886  plasma membrane

Molecular Function

GO:0005332  gamma-aminobutyric acid:sodium symporter activity
GO:0042165  neurotransmitter binding
GO:0005328  neurotransmitter:sodium symporter activity