snail homolog 2 (Drosophila)

同義遺伝子名

Zinc finger protein SLUG, WS2D, SLUGH, SLUG, SLUGH1, MGC10182, SNAI2, snail homolog 2 (Drosophila), Neural crest transcription factor Slug, Snail homolog 2

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

nodata

GeneChip

大脳:3.85

小脳:4.75

脳幹:3.71

脳梁:4

松果体:-

末梢神経:5.15

脊柱:4.13

網膜:-

目:-

動脈:6.07

静脈:5.39

リンパ節:5.80

末梢血:-

脾臓:6.73

胸腺:5.24

骨髄:4.53

脂肪:6.84

骨:-

皮膚:7.53

CAGE

大脳:1.50

小脳:-

脳幹:1.38

脳梁:1.72

松果体:1.87

末梢神経:-

脊柱:1.96

網膜:-

目:-

動脈:3.55

静脈:3.28

リンパ節:3.24

末梢血:-

脾臓:3.21

胸腺:2.33

骨髄:-

脂肪:3.50

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.76

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:3.61

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:2.86

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

nodata

GeneChip

子宮:8.88

胎盤:6.47

前立腺:6.97

卵巣:7.82

精巣:5.03

心臓:6

骨格筋:4.30

食道:6.16

胃:6.12

腸:6.02

結腸:6.31

肝臓:5.88

肺:5.10

膀胱:-

腎臓:5.73

下垂体:3.90

甲状腺:5.32

副腎:7.04

膵臓:4.93

乳腺:7.83

唾液腺:5.88

CAGE

子宮:4.63

胎盤:3.27

前立腺:4.45

卵巣:4.16

精巣:2.93

心臓:3.27

骨格筋:2.38

食道:3.61

胃:-

腸:2.28

結腸:3.25

肝臓:2.37

肺:3.03

膀胱:3.96

腎臓:3.69

下垂体:2.11

甲状腺:2.41

副腎:-

膵臓:2.60

乳腺:4.97

唾液腺:2.85

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:3.79

卵巣:4.69

精巣:3.86

心臓:2.09

骨格筋:1.11

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.71

肝臓:1.39

肺:2.09

膀胱:-

腎臓:4.29

下垂体:-

甲状腺:2.71

副腎:3.42

膵臓:-

乳腺:3.24

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_003068
Gene ID	6591
Unigene ID	-
Probe set ID	213139_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000019549
GTEx ID	ENSG00000019549

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_011415
ラット[1]	NM_011415

染色体

8q11.21 [49,830,249 - 49,834,299]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR015880	Zinc finger, C2H2-like
IPR007087	Zinc finger, C2H2-type

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0060536	cartilage morphogenesis
GO:0003273	cell migration involved in endocardial cushion formation
GO:0071364	cellular response to epidermal growth factor stimulus
GO:0071479	cellular response to ionizing radiation
GO:0009790	embryonic development
GO:0001837	epithelial to mesenchymal transition
GO:0003198	epithelial to mesenchymal transition involved in endocardial cushion formation
GO:0060429	epithelium development
GO:0006933	negative regulation of cell adhesion involved in substrate-bound cell migration
GO:0033629	negative regulation of cell adhesion mediated by integrin
GO:0032331	negative regulation of chondrocyte differentiation
GO:0043518	negative regulation of DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator
GO:0010839	negative regulation of keratinocyte proliferation
GO:0000122	negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0010957	negative regulation of vitamin D biosynthetic process
GO:0070563	negative regulation of vitamin D receptor signaling pathway
GO:0090090	negative regulation of Wnt receptor signaling pathway through beta-catenin
GO:0014032	neural crest cell development
GO:0007219	Notch signaling pathway
GO:0001649	osteoblast differentiation
GO:0060021	palate development
GO:0043473	pigmentation
GO:0030335	positive regulation of cell migration
GO:0045600	positive regulation of fat cell differentiation
GO:0035066	positive regulation of histone acetylation
GO:0032642	regulation of chemokine production
GO:0045667	regulation of osteoblast differentiation
GO:0007605	sensory perception of sound
GO:0050872	white fat cell differentiation
GO:0060070	Wnt receptor signaling pathway through beta-catenin

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0000790	nuclear chromatin
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0003682	chromatin binding
GO:0046872	metal ion binding
GO:0003705	RNA polymerase II transcription factor activity, enhancer binding
GO:0043565	sequence-specific DNA binding

snail homolog 2 (Drosophila)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function