helicase-like transcription factor

同義遺伝子名

ZBU1, HIP116A, SMARCA3, HIP116, Helicase-like transcription factor, HLTF1, HLTF, Sucrose nonfermenting protein 2-like 3, RNF80, SNF2L3

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:-

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:18.20

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:4.80

GeneChip

大脳:7.07

小脳:7.62

脳幹:7.51

脳梁:7.29

松果体:-

末梢神経:6.85

脊柱:7.49

網膜:-

目:-

動脈:6.44

静脈:6.24

リンパ節:6.22

末梢血:-

脾臓:6.20

胸腺:7.28

骨髄:6.35

脂肪:6.59

骨:-

皮膚:5.70

CAGE

大脳:4.00

小脳:-

脳幹:4.12

脳梁:3.70

松果体:4.20

末梢神経:-

脊柱:4.02

網膜:-

目:-

動脈:3.34

静脈:3.16

リンパ節:2.78

末梢血:-

脾臓:3.21

胸腺:3.78

骨髄:-

脂肪:3.34

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.33

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.00

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.52

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:-

前立腺:22.50

卵巣:37.30

精巣:26

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:21.20

腸:-

結腸:-

肝臓:10.60

肺:-

膀胱:376.80

腎臓:10.40

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:7.14

胎盤:5.49

前立腺:7.50

卵巣:7.26

精巣:8.49

心臓:6.73

骨格筋:6.49

食道:5.49

胃:6.30

腸:6.35

結腸:5.18

肝臓:6.43

肺:5.70

膀胱:-

腎臓:6.10

下垂体:7.40

甲状腺:7.05

副腎:7.13

膵臓:6.02

乳腺:6.39

唾液腺:6.27

CAGE

子宮:3.61

胎盤:2.83

前立腺:3.57

卵巣:3.57

精巣:4.61

心臓:3.32

骨格筋:2.45

食道:3.09

胃:-

腸:2.63

結腸:2.95

肝臓:3.24

肺:2.97

膀胱:3.42

腎臓:3.42

下垂体:4.41

甲状腺:3.54

副腎:-

膵臓:2.71

乳腺:3.06

唾液腺:3.11

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:1.28

卵巣:0.58

精巣:3.30

心臓:1.43

骨格筋:0.00

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.79

肝臓:0.11

肺:0.55

膀胱:-

腎臓:0.36

下垂体:-

甲状腺:1.62

副腎:1.30

膵臓:-

乳腺:1.51

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_139048
Gene ID	6596
Unigene ID	Hs.306812
Probe set ID	202983_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000071794
GTEx ID	ENSG00000071794

オーソログ対応遺伝子

マウス[4]	NM_009210, NM_144959
ラット[1]	NM_001106478, NM_144959

染色体

3q24 [148,747,914 - 148,804,341]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR014001	DEAD-like helicase, N-terminal
IPR014021	Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0016568	chromatin modification
GO:0016567	protein ubiquitination
GO:0006357	regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006355	regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351	transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0005730	nucleolus
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0005524	ATP binding
GO:0016887	ATPase activity
GO:0003677	DNA binding
GO:0004386	helicase activity
GO:0016874	ligase activity
GO:0005515	protein binding
GO:0008270	zinc ion binding

helicase-like transcription factor

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function