SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily c, member 2

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同義遺伝子名

BAF170, CRACC2, BRG1-associated factor 170, SMARCC2, SWI/SNF complex 170 kDa subunit, Rsc8

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:126.80

小脳:176.30

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:92

脊柱:-

網膜:118.60

目:152.80

動脈:-

静脈:-

リンパ節:121.30

末梢血:72.90

脾臓:113.40

胸腺:244.80

骨髄:118.10

脂肪:-

骨:102.40

皮膚:168

GeneChip

大脳:8.04

小脳:8.15

脳幹:7.89

脳梁:7.90

松果体:-

末梢神経:7.69

脊柱:7.85

網膜:-

目:-

動脈:7.95

静脈:7.70

リンパ節:7.81

末梢血:-

脾臓:7.82

胸腺:7.62

骨髄:7.47

脂肪:7.76

骨:-

皮膚:7.63

CAGE

大脳:3.94

小脳:-

脳幹:3.92

脳梁:4.03

松果体:3.99

末梢神経:-

脊柱:3.65

網膜:-

目:-

動脈:3.89

静脈:3.63

リンパ節:3.40

末梢血:-

脾臓:3.48

胸腺:3.50

骨髄:-

脂肪:3.79

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.93

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.14

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.13

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:100.20

胎盤:109.30

前立腺:90.10

卵巣:335.40

精巣:47.60

心臓:89.40

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:97.20

結腸:93.30

肝臓:42.20

肺:88

膀胱:125.60

腎臓:72.80

下垂体:232

甲状腺:818.70

副腎:-

膵臓:80

乳腺:83.60

唾液腺:-

GeneChip

子宮:7.61

胎盤:7.14

前立腺:7.57

卵巣:7.68

精巣:7.69

心臓:7.51

骨格筋:7.34

食道:7.41

胃:7.43

腸:7.37

結腸:7.64

肝臓:7.46

肺:7.77

膀胱:-

腎臓:7.77

下垂体:7.89

甲状腺:8.06

副腎:7.81

膵臓:7.42

乳腺:8.08

唾液腺:7.59

CAGE

子宮:3.86

胎盤:3.20

前立腺:3.80

卵巣:3.71

精巣:3.01

心臓:3.34

骨格筋:3.18

食道:3.40

胃:-

腸:3.47

結腸:3.58

肝臓:2.45

肺:3.59

膀胱:3.39

腎臓:3.27

下垂体:3.38

甲状腺:3.54

副腎:-

膵臓:3.52

乳腺:3.73

唾液腺:3.83

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.63

卵巣:0.62

精巣:1.01

心臓:0.09

骨格筋:1.39

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.42

肝臓:0.53

肺:0.39

膀胱:-

腎臓:0.14

下垂体:-

甲状腺:1.07

副腎:0.13

膵臓:-

乳腺:0.21

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001130420
Gene ID	6601
Unigene ID	Hs.236030
Probe set ID	201320_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000139613
GTEx ID	ENSG00000139613

オーソログ対応遺伝子

マウス[3]	NM_001114096, NM_001114097, NM_198160
ラット[3]	NM_001114096, NM_001114097, NM_198160

染色体

12q13.2 [56,556,767 - 56,583,351]

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- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000953	Chromo domain
IPR009057	Homeodomain-like
IPR012287	Homeodomain-related
IPR017877	MYB-like
IPR001005	SANT, DNA-binding

GO:0006338	chromatin remodeling
GO:0045892	negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0007399	nervous system development
GO:0006337	nucleosome disassembly
GO:0045893	positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006357	regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006351	transcription, DNA-dependent

GO:0005730	nucleolus
GO:0005634	nucleus
GO:0016514	SWI/SNF complex
GO:0017053	transcriptional repressor complex

GO:0003682	chromatin binding
GO:0003677	DNA binding
GO:0005515	protein binding
GO:0003713	transcription coactivator activity

SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily c, member 2

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function