SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily d, member 3

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同義遺伝子名

SMARCD3, CRACD3, BRG1-associated factor 60C, MGC111010, BAF60C, 60 kDa BRG-1/Brm-associated factor subunit C

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:- 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
GeneChip 大脳:7.31 小脳:7.05 脳幹:7.17 脳梁:6.35 松果体:- 末梢神経:6.42 脊柱:6.69 網膜:- 目:- 動脈:7.24 静脈:7.02 リンパ節:5.76 末梢血:- 脾臓:5.08 胸腺:4.56 骨髄:5.19 脂肪:6.09 骨:- 皮膚:6.03
CAGE 大脳:4.07 小脳:- 脳幹:3.75 脳梁:3.41 松果体:3.02 末梢神経:- 脊柱:3.89 網膜:- 目:- 動脈:4.12 静脈:2.60 リンパ節:2.40 末梢血:- 脾臓:2.20 胸腺:0.88 骨髄:- 脂肪:2.57 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:3.32 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:3.00 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:3.06 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.38 胎盤:4.56 前立腺:6.12 卵巣:6.93 精巣:6.43 心臓:7.30 骨格筋:7.80 食道:6 胃:5.68 腸:6.23 結腸:5.58 肝臓:4.43 肺:5.85 膀胱:- 腎臓:5.62 下垂体:6.98 甲状腺:6.50 副腎:7.32 膵臓:5.52 乳腺:6.19 唾液腺:5.53
CAGE 子宮:3.20 胎盤:1.59 前立腺:3.39 卵巣:3.95 精巣:3.12 心臓:3.70 骨格筋:4.84 食道:2.96 胃:- 腸:2.04 結腸:2.66     肝臓:0.55    肺:2.98 膀胱:3.18 腎臓:2.77 下垂体:3.74 甲状腺:2.95 副腎:- 膵臓:3.29 乳腺:3.49 唾液腺:2.60
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.36 卵巣:5.15 精巣:4.85 心臓:3.70 骨格筋:4.64 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:3.40     肝臓:0.62        肺:2.44    膀胱:- 腎臓:3.22 下垂体:- 甲状腺:3.50 副腎:3.46 膵臓:- 乳腺:3.36 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001003801
Gene ID 6604
Unigene ID Hs.647067
Probe set ID 204099_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000082014
GTEx ID ENSG00000082014

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_025891
ラット[1]  NM_001011966

染色体

7q36.1  [150,935,850  -  150,974,982]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR019835  SWIB domain
IPR003121  SWIB/MDM2 domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8804307
8895581
9693044
9891079
11726552
12477932
12690205
12853948
14697242
14701856
15489334
16687403
17081983
17363140
17474147
18816825
20305087
21694703
21906983
22068056
22505724
22833560
22939629
23219531
23382691
23563706
23716599
24250222
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0003219  cardiac right ventricle formation
GO:0044255  cellular lipid metabolic process
GO:0006338  chromatin remodeling
GO:0042692  muscle cell differentiation
GO:0003407  neural retina development
GO:0006337  nucleosome disassembly
GO:0002052  positive regulation of neuroblast proliferation
GO:0045893  positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0043393  regulation of protein binding
GO:0006357  regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0003139  secondary heart field specification
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0000790  nuclear chromatin
GO:0005654  nucleoplasm
GO:0005634  nucleus
GO:0016514  SWI/SNF complex

Molecular Function

GO:0016922  ligand-dependent nuclear receptor binding
GO:0030374  ligand-dependent nuclear receptor transcription coactivator activity
GO:0035257  nuclear hormone receptor binding
GO:0005515  protein binding
GO:0005102  receptor binding
GO:0003713  transcription coactivator activity
GO:0008134  transcription factor binding