SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1

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同義遺伝子名

SMARCE1, BAF57, BRG1-associated factor 57

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

nodata

GeneChip

大脳:6.46

小脳:6.67

脳幹:6.50

脳梁:6.86

松果体:-

末梢神経:7.16

脊柱:6.61

網膜:-

目:-

動脈:7.29

静脈:7.46

リンパ節:7.48

末梢血:-

脾臓:7.62

胸腺:8.71

骨髄:7.32

脂肪:7.34

骨:-

皮膚:7.38

CAGE

大脳:2.90

小脳:-

脳幹:3.08

脳梁:3.12

松果体:2.91

末梢神経:-

脊柱:3.17

網膜:-

目:-

動脈:3.19

静脈:3.27

リンパ節:3.29

末梢血:-

脾臓:3.43

胸腺:3.92

骨髄:-

脂肪:3.45

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:4.29

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:5.05

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:5.12

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

nodata

GeneChip

子宮:8.31

胎盤:7.56

前立腺:7.71

卵巣:8.03

精巣:7.50

心臓:7.02

骨格筋:6.70

食道:7.61

胃:7.31

腸:7.49

結腸:7.15

肝臓:6.68

肺:7.45

膀胱:-

腎臓:6.69

下垂体:6.44

甲状腺:7.35

副腎:6.81

膵臓:7.25

乳腺:7.45

唾液腺:6.88

CAGE

子宮:3.59

胎盤:3.45

前立腺:3.60

卵巣:3.71

精巣:3.19

心臓:3.11

骨格筋:3.29

食道:3.52

胃:-

腸:3.33

結腸:2.77

肝臓:3.06

肺:3.24

膀胱:3.64

腎臓:3.35

下垂体:2.93

甲状腺:3.28

副腎:-

膵臓:2.98

乳腺:3.35

唾液腺:2.93

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:5.52

卵巣:5.81

精巣:5.50

心臓:4.22

骨格筋:4.29

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:5.38

肝臓:4.12

肺:4.55

膀胱:-

腎臓:5.08

下垂体:-

甲状腺:5.30

副腎:5.54

膵臓:-

乳腺:5.24

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_003079
Gene ID	6605
Unigene ID	-
Probe set ID	211989_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000073584
GTEx ID	ENSG00000073584

オーソログ対応遺伝子

マウス[4]	NM_020618
ラット[4]	NM_020618

染色体

17q21.2 [38,781,214 - 38,821,393]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000910	High mobility group, HMG1/HMG2
IPR009071	High mobility group, superfamily

GO:0006338	chromatin remodeling
GO:0045892	negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0007399	nervous system development
GO:0006337	nucleosome disassembly
GO:0006357	regulation of transcription from RNA polymerase II promoter

GO:0000228	nuclear chromosome
GO:0005730	nucleolus
GO:0005634	nucleus
GO:0016514	SWI/SNF complex
GO:0017053	transcriptional repressor complex

GO:0003682	chromatin binding
GO:0003677	DNA binding
GO:0016922	ligand-dependent nuclear receptor binding
GO:0008080	N-acetyltransferase activity
GO:0005515	protein binding
GO:0047485	protein N-terminus binding
GO:0003713	transcription coactivator activity

SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function