small nuclear RNA activating complex, polypeptide 4, 190kDa

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

SNAPc 190 kDa subunit, PTF subunit alpha, SNAPc subunit 4, FLJ13451, PTFalpha, PSE-binding factor subunit alpha, snRNA-activating protein complex subunit 4, snRNA-activating protein complex 190 kDa subunit, polypeptide 4, SNAP190, SNAPC4

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:1.20 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:61.30 脊柱:- 網膜:- 目:17.60 動脈:- 静脈:- リンパ節:40.40 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:25.80 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
GeneChip 大脳:7.17 小脳:7.26 脳幹:7.13 脳梁:6.99 松果体:- 末梢神経:6.89 脊柱:6.94 網膜:- 目:- 動脈:7.07 静脈:6.91 リンパ節:7.16 末梢血:- 脾臓:7.07 胸腺:7.17 骨髄:7.14 脂肪:7.07 骨:- 皮膚:7.17
CAGE 大脳:2.54 小脳:- 脳幹:2.36 脳梁:2.56 松果体:2.05 末梢神経:- 脊柱:2.08 網膜:- 目:- 動脈:2.00 静脈:2.13 リンパ節:2.23 末梢血:- 脾臓:2.16 胸腺:2.37 骨髄:- 脂肪:2.07 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.15 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.17 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:1.10 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:9.10 胎盤:14.60 前立腺:22.50 卵巣:- 精巣:13 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:25.40     肝臓:-        肺:4.90    膀胱:- 腎臓:10.40 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:8.90 乳腺:27.90 唾液腺:-
GeneChip 子宮:7.01 胎盤:6.79 前立腺:6.83 卵巣:7.07 精巣:7.63 心臓:6.74 骨格筋:7.14 食道:6.97 胃:7.01 腸:7.11 結腸:7.06 肝臓:7.29 肺:6.95 膀胱:- 腎臓:7.05 下垂体:7.38 甲状腺:7.21 副腎:6.96 膵臓:6.90 乳腺:7.09 唾液腺:7.16
CAGE 子宮:2.37 胎盤:1.99 前立腺:2.21 卵巣:2.25 精巣:2.61 心臓:1.76 骨格筋:1.62 食道:1.59 胃:- 腸:1.90 結腸:2.24     肝臓:1.71    肺:1.67 膀胱:1.86 腎臓:1.76 下垂体:2.61 甲状腺:1.97 副腎:- 膵臓:2.76 乳腺:2.02 唾液腺:2.01
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:1.31 卵巣:1.90 精巣:2.12 心臓:0.55 骨格筋:1.13 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.67     肝臓:0.62        肺:0.75    膀胱:- 腎臓:0.91 下垂体:- 甲状腺:1.66 副腎:1.91 膵臓:- 乳腺:1.17 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_003086
Gene ID 6621
Unigene ID Hs.113265
Probe set ID 215926_x_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000165684
GTEx ID ENSG00000165684

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_172339
ラット[1]  NM_172339

染色体

9q34.3  [139,270,029  -  139,293,249]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR009057  Homeodomain-like
IPR012287  Homeodomain-related
IPR017877  MYB-like
IPR001005  SANT, DNA-binding

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

7715707
8524284
9418884
11056176
11856838
12477932
12621023
14702039
15164053
15231747
15302935
15955816
17643375
17670747
20237496
20379614
20463747
20562859
21102463
21139048
21297633
21900206
22936669

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0010467  gene expression
GO:0009301  snRNA transcription
GO:0042795  snRNA transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0042796  snRNA transcription from RNA polymerase III promoter
GO:0006366  transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006383  transcription from RNA polymerase III promoter

Cellular Component

GO:0005654  nucleoplasm
GO:0005634  nucleus
GO:0019185  snRNA-activating protein complex

Molecular Function

GO:0003682  chromatin binding
GO:0003677  DNA binding
GO:0003700  transcription factor activity