small nuclear ribonucleoprotein polypeptide C

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同義遺伝子名

small nuclear ribonucleoprotein polypeptide C, U1C protein, SNRPC, FLJ20302, U1-C, U1 snRNP protein C, U1 small nuclear ribonucleoprotein C

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:42.70 小脳:63 脳幹:- 脳梁:- 松果体:148.30 末梢神経:30.70 脊柱:- 網膜:- 目:47 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:4.80
GeneChip 大脳:7.73 小脳:7.56 脳幹:7.77 脳梁:7.76 松果体:- 末梢神経:7.83 脊柱:7.84 網膜:- 目:- 動脈:7.83 静脈:7.99 リンパ節:7.89 末梢血:- 脾臓:7.66 胸腺:8.32 骨髄:8.02 脂肪:7.98 骨:- 皮膚:7.99
CAGE 大脳:3.13 小脳:- 脳幹:3.06 脳梁:2.92 松果体:3.05 末梢神経:- 脊柱:2.79 網膜:- 目:- 動脈:3.27 静脈:3.41 リンパ節:3.29 末梢血:- 脾臓:3.08 胸腺:3.48 骨髄:- 脂肪:2.91 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:3.24 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:3.39 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:3.43 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:10.90 前立腺:- 卵巣:- 精巣:43.30 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:8.50     肝臓:-        肺:-    膀胱:- 腎臓:20.80 下垂体:232 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:80 乳腺:9.30 唾液腺:-
GeneChip 子宮:7.99 胎盤:7.87 前立腺:7.97 卵巣:8.16 精巣:8.86 心臓:8.13 骨格筋:8.07 食道:7.86 胃:7.79 腸:8.10 結腸:8 肝臓:7.62 肺:7.78 膀胱:- 腎臓:7.86 下垂体:7.94 甲状腺:8.13 副腎:7.62 膵臓:8.24 乳腺:7.93 唾液腺:8.14
CAGE 子宮:3.03 胎盤:3.15 前立腺:3.14 卵巣:2.94 精巣:4.19 心臓:3.78 骨格筋:3.93 食道:3.30 胃:- 腸:3.23 結腸:2.85     肝臓:3.29    肺:3.14 膀胱:2.95 腎臓:3.07 下垂体:3.02 甲状腺:3.49 副腎:- 膵臓:4.01 乳腺:2.95 唾液腺:3.42
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:4.59 卵巣:3.88 精巣:5.12 心臓:4.61 骨格筋:4.37 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:3.14     肝臓:3.94        肺:1.83    膀胱:- 腎臓:2.33 下垂体:- 甲状腺:4.38 副腎:4.35 膵臓:- 乳腺:3.69 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_003093
Gene ID 6631
Unigene ID Hs.106311
Probe set ID 201342_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000124562
GTEx ID ENSG00000124562

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_011432
ラット[2]  NM_011432

染色体

6p21.31  [34,725,183  -  34,741,571]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000690  Zinc finger, C2H2-type matrin
IPR003604  Zinc finger, U1-type

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1826349
2961811
2971157
8076607
8125298
8532530
8798632
8972845
9031639
9826776
10068039
10725331
10827180
11748230
12477932
12486009
15312772
15525645
15635413
16159877
17332742
18854154
21139048
21145461
21150319
21642987
21890473
21906983
22174317
22365833
22505724
22939629
22990118
23000965
23463506
23602568

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0000395  nuclear mRNA 5'-splice site recognition
GO:0000398  nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0000387  spliceosomal snRNP assembly

Cellular Component

GO:0015030  Cajal body
GO:0000243  commitment complex
GO:0005685  U1 snRNP
GO:0071004  U2-type prespliceosome

Molecular Function

GO:0003729  mRNA binding
GO:0005515  protein binding
GO:0042803  protein homodimerization activity
GO:0003727  single-stranded RNA binding
GO:0030619  U1 snRNA binding
GO:0008270  zinc ion binding