syntrophin, alpha 1 (dystrophin-associated protein A1, 59kDa, acidic component)

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同義遺伝子名

Syntrophin 1, SNT1, SNTA1, dJ1187J4.5, Alpha-1-syntrophin, TACIP1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:65.20

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:61.30

脊柱:-

網膜:118.60

目:82.30

動脈:-

静脈:-

リンパ節:60.70

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:12.80

皮膚:33.60

GeneChip

大脳:7.81

小脳:7

脳幹:7.76

脳梁:7.63

松果体:-

末梢神経:7.04

脊柱:7.61

網膜:-

目:-

動脈:7.64

静脈:7.53

リンパ節:6.51

末梢血:-

脾臓:6.24

胸腺:6.04

骨髄:6.37

脂肪:7.09

骨:-

皮膚:6.75

CAGE

大脳:3.77

小脳:-

脳幹:3.39

脳梁:3.94

松果体:2.07

末梢神経:-

脊柱:3.30

網膜:-

目:-

動脈:3.56

静脈:3.04

リンパ節:2.05

末梢血:-

脾臓:1.09

胸腺:1.35

骨髄:-

脂肪:3.30

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:4.58

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:3.07

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:4.09

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:18.20

前立腺:45.10

卵巣:37.30

精巣:21.60

心臓:217.10

骨格筋:341.50

食道:-

胃:21.20

腸:32.40

結腸:8.50

肝臓:-

肺:9.80

膀胱:-

腎臓:62.40

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:50.80

膵臓:71.10

乳腺:9.30

唾液腺:-

GeneChip

子宮:6.53

胎盤:6.49

前立腺:6.44

卵巣:6.62

精巣:6.81

心臓:8.12

骨格筋:8.67

食道:7.19

胃:6.65

腸:7.03

結腸:6.80

肝臓:6.82

肺:6.46

膀胱:-

腎臓:7.21

下垂体:6.81

甲状腺:8.18

副腎:6.72

膵臓:6.51

乳腺:6.68

唾液腺:7.10

CAGE

子宮:2.61

胎盤:1.57

前立腺:3.14

卵巣:3.00

精巣:3.33

心臓:4.30

骨格筋:4.59

食道:2.92

胃:-

腸:2.51

結腸:2.56

肝臓:1.74

肺:2.07

膀胱:3.44

腎臓:2.58

下垂体:1.57

甲状腺:4.43

副腎:-

膵臓:2.76

乳腺:2.95

唾液腺:3.13

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:4.37

卵巣:3.61

精巣:4.08

心臓:5.37

骨格筋:6.31

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:3.48

肝臓:1.91

肺:1.93

膀胱:-

腎臓:2.96

下垂体:-

甲状腺:6.12

副腎:3.55

膵臓:-

乳腺:4.23

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_003098
Gene ID	6640
Unigene ID	Hs.31121
Probe set ID	203516_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000101400
GTEx ID	ENSG00000101400

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_009228
ラット[1]	NM_001100901

染色体

20q11.21 [31,995,761 - 32,031,698]

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- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001849

Pleckstrin homology

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0006936	muscle contraction
GO:0007528	neuromuscular junction development
GO:0002027	regulation of heart rate
GO:0003117	regulation of vasoconstriction by circulating norepinephrine
GO:0060307	regulation of ventricular cardiomyocyte membrane repolarization

Cellular Component

GO:0030054	cell junction
GO:0005737	cytoplasm
GO:0005856	cytoskeleton
GO:0005622	intracellular
GO:0016328	lateral plasma membrane
GO:0045211	postsynaptic membrane
GO:0043234	protein complex
GO:0042383	sarcolemma
GO:0016013	syntrophin complex

Molecular Function

GO:0003779	actin binding
GO:0051117	ATPase binding
GO:0005516	calmodulin binding
GO:0050998	nitric-oxide synthase binding
GO:0005543	phospholipid binding
GO:0005515	protein binding
GO:0017080	sodium channel regulator activity

syntrophin, alpha 1 (dystrophin-associated protein A1, 59kDa, acidic component)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function