syntrophin, beta 1 (dystrophin-associated protein A1, 59kDa, basic component 1)

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同義遺伝子名

A1B, MGC111389, SNT2B1, SNT2, FLJ22442, DAPA1B, 59-DAP, TIP-43, BSYN2, Beta-1-syntrophin, SNTB1, Tax interaction protein 43, Syntrophin 2

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:10.70 小脳:25.20 脳幹:- 脳梁:- 松果体:148.30 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:35.30 動脈:- 静脈:- リンパ節:20.20 末梢血:- 脾臓:18.90 胸腺:12.90 骨髄:- 脂肪:- 骨:25.60 皮膚:38.40
GeneChip 大脳:3.27 小脳:3.39 脳幹:3.28 脳梁:3.40 松果体:- 末梢神経:3.39 脊柱:3.55 網膜:- 目:- 動脈:3.41 静脈:3.38 リンパ節:3.44 末梢血:- 脾臓:3.46 胸腺:3.10 骨髄:3.79 脂肪:3.48 骨:- 皮膚:3.34
CAGE 大脳:2.05 小脳:- 脳幹:2.19 脳梁:2.60 松果体:2.97 末梢神経:- 脊柱:2.24 網膜:- 目:- 動脈:2.24 静脈:2.40 リンパ節:2.53 末梢血:- 脾臓:3.24 胸腺:2.11 骨髄:- 脂肪:2.87 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.21 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.58 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.85 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:27.30 胎盤:32.80 前立腺:11.30 卵巣:- 精巣:26 心臓:51.10 骨格筋:20.10 食道:- 胃:21.20 腸:- 結腸:59.40     肝臓:105.60        肺:34.20    膀胱:- 腎臓:52 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:18.60 唾液腺:-
GeneChip 子宮:3.22 胎盤:3.27 前立腺:3.22 卵巣:3.04 精巣:3.14 心臓:3.16 骨格筋:3.33 食道:3.25 胃:3.61 腸:3.73 結腸:3.17 肝臓:4.50 肺:3.60 膀胱:- 腎臓:3.33 下垂体:3.26 甲状腺:4.07 副腎:4.89 膵臓:3.74 乳腺:3.19 唾液腺:4.61
CAGE 子宮:2.48 胎盤:2.20 前立腺:2.39 卵巣:1.98 精巣:1.83 心臓:2.22 骨格筋:2.54 食道:2.99 胃:- 腸:2.25 結腸:2.28     肝臓:4.63    肺:3.80 膀胱:2.51 腎臓:2.47 下垂体:1.35 甲状腺:4.33 副腎:- 膵臓:3.84 乳腺:3.45 唾液腺:3.84
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:2.50 卵巣:1.79 精巣:2.67 心臓:1.24 骨格筋:2.48 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.98     肝臓:5.46        肺:3.51    膀胱:- 腎臓:2.81 下垂体:- 甲状腺:4.77 副腎:2.50 膵臓:- 乳腺:2.75 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_021021
Gene ID 6641
Unigene ID Hs.46701
Probe set ID 214708_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000172164
GTEx ID ENSG00000172164

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_016667
ラット [0]  

染色体

8q24.12  [121,547,985  -  121,825,513]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001849  Pleckstrin homology

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

7844150
8119949
8183929
8576247
9412493
9482110
10212242
10545507
11069112
11168526
11352924
12136098
12477932
12665801
15024025
15489334
16192269
16192270
16192292
16533813
18468998
19343720
20208534
20889312
22721673
23406873
23782696
23933737
24024966
24255178
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006936  muscle contraction

Cellular Component

GO:0030054  cell junction
GO:0005737  cytoplasm
GO:0005856  cytoskeleton
GO:0016010  dystrophin-associated glycoprotein complex
GO:0043234  protein complex
GO:0042383  sarcolemma
GO:0045202  synapse

Molecular Function

GO:0003779  actin binding
GO:0005516  calmodulin binding
GO:0030165  PDZ domain binding
GO:0005543  phospholipid binding
GO:0005515  protein binding