sorting nexin 1

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同義遺伝子名

SNX1A, MGC8664, sorting nexin 1, SNX1, Sorting nexin-1, HsT17379

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:133.90

小脳:12.60

脳幹:-

脳梁:175

松果体:148.30

末梢神経:214.70

脊柱:-

網膜:-

目:76.40

動脈:-

静脈:199.90

リンパ節:151.70

末梢血:200.40

脾臓:18.90

胸腺:141.70

骨髄:137.80

脂肪:322.70

骨:51.20

皮膚:129.60

GeneChip

大脳:6.06

小脳:5.05

脳幹:6.51

脳梁:6.82

松果体:-

末梢神経:5.96

脊柱:6.85

網膜:-

目:-

動脈:5.89

静脈:5.93

リンパ節:6.33

末梢血:-

脾臓:6.49

胸腺:6.96

骨髄:6.30

脂肪:6.35

骨:-

皮膚:6.17

CAGE

大脳:4.46

小脳:-

脳幹:4.78

脳梁:5.08

松果体:4.94

末梢神経:-

脊柱:4.93

網膜:-

目:-

動脈:4.78

静脈:4.56

リンパ節:4.49

末梢血:-

脾臓:4.57

胸腺:4.53

骨髄:-

脂肪:4.68

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.48

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.03

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.25

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:118.50

胎盤:65.60

前立腺:45.10

卵巣:111.80

精巣:73.50

心臓:63.90

骨格筋:60.30

食道:-

胃:42.50

腸:97.20

結腸:110.20

肝臓:95

肺:63.50

膀胱:502.40

腎臓:41.60

下垂体:-

甲状腺:491.20

副腎:-

膵臓:231.20

乳腺:325.30

唾液腺:-

GeneChip

子宮:6.69

胎盤:6.16

前立腺:7.16

卵巣:6.44

精巣:6.41

心臓:6.31

骨格筋:5.72

食道:6.76

胃:6

腸:6.43

結腸:6.24

肝臓:6.27

肺:6.50

膀胱:-

腎臓:6.49

下垂体:5.42

甲状腺:7.19

副腎:6.33

膵臓:5.83

乳腺:6.29

唾液腺:6.39

CAGE

子宮:4.74

胎盤:4.37

前立腺:4.56

卵巣:4.45

精巣:4.20

心臓:4.68

骨格筋:4.43

食道:4.48

胃:-

腸:4.43

結腸:4.47

肝臓:4.57

肺:4.77

膀胱:4.46

腎臓:4.57

下垂体:4.23

甲状腺:5.52

副腎:-

膵臓:4.57

乳腺:4.86

唾液腺:4.21

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.00

卵巣:0.39

精巣:0.22

心臓:0.20

骨格筋:0.21

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.22

肝臓:0.03

肺:0.61

膀胱:-

腎臓:0.04

下垂体:-

甲状腺:0.43

副腎:0.00

膵臓:-

乳腺:0.17

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_148955
Gene ID	6642
Unigene ID	Hs.188634
Probe set ID	214531_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000028528
GTEx ID	ENSG00000028528

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_019727
ラット[1]	NM_053411

染色体

15q22.31 [64,388,177 - 64,436,433]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0007154	cell communication
GO:0034498	early endosome to Golgi transport
GO:0006897	endocytosis
GO:0006886	intracellular protein transport
GO:0045732	positive regulation of protein catabolic process

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0005829	cytosol
GO:0031901	early endosome membrane
GO:0010008	endosome membrane
GO:0005794	Golgi apparatus
GO:0043231	intracellular membrane-bounded organelle

Molecular Function

GO:0035091	phosphoinositide binding
GO:0005515	protein binding
GO:0008565	protein transporter activity

sorting nexin 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function