SRY (sex determining region Y)-box 1

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同義遺伝子名

SOX1, SOX-1 protein, SRY (sex determining region Y)-box 1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:28.40 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:112.30 網膜:- 目:17.60 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
GeneChip 大脳:3.54 小脳:3.49 脳幹:3.66 脳梁:3.40 松果体:- 末梢神経:3.33 脊柱:3.28 網膜:- 目:- 動脈:3.63 静脈:3.64 リンパ節:3.44 末梢血:- 脾臓:3.29 胸腺:3.37 骨髄:3.51 脂肪:3.70 骨:- 皮膚:3.84
CAGE 大脳:0.89 小脳:- 脳幹:0.54 脳梁:0.88 松果体:0 末梢神経:- 脊柱:0.89 網膜:- 目:- 動脈:0 静脈:0 リンパ節:0 末梢血:- 脾臓:0 胸腺:0 骨髄:- 脂肪:0 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.07 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:3.39 胎盤:3.24 前立腺:3.47 卵巣:3.67 精巣:3.57 心臓:3.49 骨格筋:3.73 食道:3.45 胃:3.31 腸:3.43 結腸:3.35 肝臓:3.44 肺:3.40 膀胱:- 腎臓:3.35 下垂体:3.45 甲状腺:3.33 副腎:3.29 膵臓:3.53 乳腺:3.38 唾液腺:3.38
CAGE 子宮:0 胎盤:0 前立腺:0.08 卵巣:0 精巣:0.28 心臓:0 骨格筋:0 食道:0 胃:- 腸:0 結腸:0.35     肝臓:0    肺:0 膀胱:0 腎臓:0 下垂体:0 甲状腺:0 副腎:- 膵臓:0 乳腺:0 唾液腺:0
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0 卵巣:0.01 精巣:1.20 心臓:0 骨格筋:0 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.07     肝臓:0        肺:0    膀胱:- 腎臓:0 下垂体:- 甲状腺:0 副腎:0.01 膵臓:- 乳腺:0.01 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_005986
Gene ID 6656
Unigene ID Hs.202526
Probe set ID 208533_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000182968
GTEx ID ENSG00000182968

オーソログ対応遺伝子

マウス [0]  
ラット [0]  

染色体

13q34  [112,721,913  -  112,726,020]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000910  High mobility group, HMG1/HMG2
IPR009071  High mobility group, superfamily

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9337405
9512512
10729834
11071752
12100890
12194848
15110721
18032743
19061938
19667272
20515335
20634891
20844123
22767186
22860217
23215838
23278580
23927962
23994634

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006325  chromatin organization
GO:0021884  forebrain neuron development
GO:0002089  lens morphogenesis in camera-type eye
GO:0001764  neuron migration
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351  transcription, DNA-dependent
GO:0021521  ventral spinal cord interneuron specification

Cellular Component

GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0003677  DNA binding
GO:0005515  protein binding
GO:0003700  transcription factor activity