spastic paraplegia 7 (pure and complicated autosomal recessive)

詳細情報を見る

同義遺伝子名

cell matrix adhesion regulator, Paraplegin, MGC126332, CMAR, SPG7, MGC126331, PGN, Spastic paraplegia protein 7

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:77

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:153.40

脊柱:112.30

網膜:-

目:88.20

動脈:-

静脈:-

リンパ節:111.20

末梢血:72.90

脾臓:94.50

胸腺:51.50

骨髄:78.70

脂肪:-

骨:89.60

皮膚:86.40

GeneChip

nodata

CAGE

大脳:4.25

小脳:-

脳幹:3.94

脳梁:4.11

松果体:4.14

末梢神経:-

脊柱:4.08

網膜:-

目:-

動脈:4.17

静脈:3.95

リンパ節:3.92

末梢血:-

脾臓:3.29

胸腺:3.53

骨髄:-

脂肪:3.56

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.80

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.69

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.80

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:82

胎盤:58.30

前立腺:112.60

卵巣:223.60

精巣:129.80

心臓:153.30

骨格筋:60.30

食道:342.80

胃:63.70

腸:32.40

結腸:186.60

肝臓:95

肺:92.90

膀胱:-

腎臓:104

下垂体:232

甲状腺:327.50

副腎:-

膵臓:44.50

乳腺:120.80

唾液腺:-

GeneChip

nodata

CAGE

子宮:3.95

胎盤:3.38

前立腺:3.57

卵巣:3.63

精巣:4.02

心臓:4.26

骨格筋:4.38

食道:3.50

胃:-

腸:3.88

結腸:4.26

肝臓:3.86

肺:3.69

膀胱:3.46

腎臓:3.43

下垂体:3.97

甲状腺:3.67

副腎:-

膵臓:4.16

乳腺:3.96

唾液腺:4.15

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.80

卵巣:0.58

精巣:1.40

心臓:1.25

骨格筋:0.86

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.46

肝臓:0.74

肺:1.12

膀胱:-

腎臓:0.83

下垂体:-

甲状腺:1.10

副腎:1.41

膵臓:-

乳腺:1.45

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_199367
Gene ID	6687
Unigene ID	Hs.185597
Probe set ID	-
Ensembl ID	ENSG00000197912
GTEx ID	ENSG00000197912

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_153176
ラット [0]

染色体

16q24.3 [89,574,811 - 89,624,174]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003593

ATPase, AAA+ type, core

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0008089	anterograde axon cargo transport
GO:0008219	cell death
GO:0007005	mitochondrion organization
GO:0007399	nervous system development
GO:0030163	protein catabolic process
GO:0006508	proteolysis

Cellular Component

GO:0016021	integral to membrane
GO:0031966	mitochondrial membrane
GO:0005739	mitochondrion

Molecular Function

GO:0005524	ATP binding
GO:0004222	metalloendopeptidase activity
GO:0017111	nucleoside-triphosphatase activity
GO:0008233	peptidase activity
GO:0005515	protein binding
GO:0051082	unfolded protein binding
GO:0008270	zinc ion binding

spastic paraplegia 7 (pure and complicated autosomal recessive)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function