spectrin, alpha, erythrocytic 1 (elliptocytosis 2)

同義遺伝子名

Spectrin alpha chain, erythrocyte, EL2, spectrin, alpha, erythrocytic 1 (elliptocytosis 2), SPTA1, SPTA, Erythroid alpha-spectrin

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:-

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:59

脂肪:40.30

骨:12.80

皮膚:4.80

GeneChip

大脳:3.12

小脳:3.25

脳幹:3.14

脳梁:3.15

松果体:-

末梢神経:3.15

脊柱:3.18

網膜:-

目:-

動脈:3.15

静脈:3.13

リンパ節:3.19

末梢血:-

脾臓:3.22

胸腺:3.23

骨髄:7.75

脂肪:3.23

骨:-

皮膚:3.08

CAGE

大脳:0

小脳:-

脳幹:0.07

脳梁:0

松果体:0

末梢神経:-

脊柱:0.09

網膜:-

目:-

動脈:0

静脈:0

リンパ節:0

末梢血:-

脾臓:0.32

胸腺:0.06

骨髄:-

脂肪:0.14

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.04

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.93

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:8.70

心臓:12.80

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:158.30

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:3.10

胎盤:3.59

前立腺:3.07

卵巣:3.07

精巣:3.39

心臓:3.08

骨格筋:3.36

食道:3.09

胃:3.22

腸:3.12

結腸:3.56

肝臓:3.23

肺:3.29

膀胱:-

腎臓:3.20

下垂体:3.21

甲状腺:3.22

副腎:3.22

膵臓:3.49

乳腺:3.13

唾液腺:3.19

CAGE

子宮:0

胎盤:1.05

前立腺:0

卵巣:0

精巣:0.12

心臓:0.16

骨格筋:0.05

食道:0

胃:-

腸:0

結腸:0

肝臓:0.14

肺:0.41

膀胱:0

腎臓:0

下垂体:0.10

甲状腺:0.17

副腎:-

膵臓:0

乳腺:0

唾液腺:0

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0

卵巣:0.02

精巣:0.14

心臓:0.01

骨格筋:0.04

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.05

肝臓:0.01

肺:0.46

膀胱:-

腎臓:0

下垂体:-

甲状腺:0.04

副腎:0.01

膵臓:-

乳腺:0.31

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_003126
Gene ID	6708
Unigene ID	Hs.119825
Probe set ID	206937_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000163554
GTEx ID	ENSG00000163554

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_011465
ラット[1]	NM_001011908

染色体

1q23.1 [158,580,278 - 158,656,488]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR018249	EF-HAND 2
IPR013315	Spectrin alpha chain, SH3 domain
IPR018159	Spectrin/alpha-actinin
IPR020473	Src homology-3, region

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0051693	actin filament capping
GO:0007015	actin filament organization
GO:0007411	axon guidance
GO:0030097	hemopoiesis
GO:0002260	lymphocyte homeostasis
GO:0007009	plasma membrane organization
GO:0006779	porphyrin biosynthetic process
GO:0032092	positive regulation of protein binding
GO:0042102	positive regulation of T cell proliferation
GO:0008360	regulation of cell shape

Cellular Component

GO:0015629	actin cytoskeleton
GO:0032437	cuticular plate
GO:0005829	cytosol
GO:0031235	intrinsic to internal side of plasma membrane
GO:0008091	spectrin
GO:0014731	spectrin-associated cytoskeleton

Molecular Function

GO:0051015	actin filament binding
GO:0005509	calcium ion binding
GO:0005515	protein binding
GO:0046982	protein heterodimerization activity
GO:0005200	structural constituent of cytoskeleton

spectrin, alpha, erythrocytic 1 (elliptocytosis 2)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function