spectrin, beta, non-erythrocytic 1

同義遺伝子名

spectrin, beta, non-erythrocytic 1, SPTB2, ELF, Fodrin beta chain, betaSpII, SPTBN1, Beta-II spectrin, Spectrin, non-erythroid beta chain 1, Spectrin beta chain, brain 1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:224

小脳:100.80

脳幹:-

脳梁:116.60

松果体:296.70

末梢神経:950.80

脊柱:673.80

網膜:118.60

目:246.80

動脈:89.90

静脈:-

リンパ節:131.40

末梢血:72.90

脾臓:132.30

胸腺:25.80

骨髄:393.60

脂肪:1008.30

骨:115.20

皮膚:571.20

GeneChip

大脳:5.60

小脳:4.63

脳幹:5.52

脳梁:6.41

松果体:-

末梢神経:7

脊柱:5.66

網膜:-

目:-

動脈:5.74

静脈:5.85

リンパ節:4.28

末梢血:-

脾臓:4.26

胸腺:4

骨髄:4.62

脂肪:6.58

骨:-

皮膚:4.91

CAGE

大脳:6.27

小脳:-

脳幹:6.09

脳梁:6.35

松果体:5.75

末梢神経:-

脊柱:6.08

網膜:-

目:-

動脈:6.06

静脈:5.92

リンパ節:4.89

末梢血:-

脾臓:5.82

胸腺:4.41

骨髄:-

脂肪:6.74

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.84

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:2.20

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:3.84

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:154.90

胎盤:240.40

前立腺:180.20

卵巣:74.50

精巣:134.10

心臓:383.20

骨格筋:140.60

食道:342.80

胃:446.10

腸:97.20

結腸:848

肝臓:105.60

肺:234.60

膀胱:-

腎臓:197.50

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:101.60

膵臓:204.50

乳腺:278.80

唾液腺:-

GeneChip

子宮:4.37

胎盤:4.47

前立腺:4.63

卵巣:4.16

精巣:4.09

心臓:7.33

骨格筋:5.71

食道:4.69

胃:4.86

腸:5.15

結腸:5.63

肝臓:4.60

肺:6.09

膀胱:-

腎臓:4.42

下垂体:4.07

甲状腺:4.38

副腎:4.74

膵臓:4.17

乳腺:4.99

唾液腺:4.54

CAGE

子宮:5.87

胎盤:5.37

前立腺:5.82

卵巣:5.75

精巣:5.60

心臓:6.45

骨格筋:5.27

食道:5.69

胃:-

腸:5.25

結腸:5.41

肝臓:5.44

肺:6.52

膀胱:5.79

腎臓:5.58

下垂体:5.18

甲状腺:5.61

副腎:-

膵臓:4.85

乳腺:6.78

唾液腺:5.46

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:2.59

卵巣:3.31

精巣:3.13

心臓:4.92

骨格筋:2.17

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:3.34

肝臓:1.16

肺:3.98

膀胱:-

腎臓:2.32

下垂体:-

甲状腺:3.45

副腎:3.25

膵臓:-

乳腺:5.00

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_178313
Gene ID	6711
Unigene ID	Hs.503178
Probe set ID	215918_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000115306
GTEx ID	ENSG00000115306

オーソログ対応遺伝子

マウス[5]	NM_009260, NM_175836
ラット[1]	NM_001013130, NM_175836

染色体

2p16.2 [54,683,422 - 54,896,812]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR016146	Calponin-homology
IPR001715	Calponin-like actin-binding
IPR001849	Pleckstrin homology
IPR018159	Spectrin/alpha-actinin
IPR001605	Spectrin/pleckstrin-like

GO:0051693	actin filament capping
GO:0007411	axon guidance
GO:0007182	common-partner SMAD protein phosphorylation
GO:0000281	cytokinesis after mitosis
GO:0043001	Golgi to plasma membrane protein transport
GO:0007009	plasma membrane organization
GO:0007184	SMAD protein nuclear translocation

GO:0030673	axolemma
GO:0032437	cuticular plate
GO:0005737	cytoplasm
GO:0005829	cytosol
GO:0031430	M band
GO:0005730	nucleolus
GO:0008091	spectrin
GO:0014731	spectrin-associated cytoskeleton

GO:0003779	actin binding
GO:0030506	ankyrin binding
GO:0005516	calmodulin binding
GO:0005543	phospholipid binding
GO:0005515	protein binding
GO:0005200	structural constituent of cytoskeleton

spectrin, beta, non-erythrocytic 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function