sorcin

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同義遺伝子名

FLJ26259, SCN, CP-22, SRI, Sorcin, 22 kDa protein, V19, sorcin

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:285.60 小脳:113.30 脳幹:- 脳梁:87.50 松果体:296.70 末梢神経:61.30 脊柱:- 網膜:- 目:99.90 動脈:30 静脈:66.60 リンパ節:40.40 末梢血:72.90 脾臓:56.70 胸腺:- 骨髄:39.40 脂肪:40.30 骨:89.60 皮膚:43.20
GeneChip 大脳:7.74 小脳:6.57 脳幹:7.89 脳梁:7.74 松果体:- 末梢神経:6.36 脊柱:8.53 網膜:- 目:- 動脈:5.70 静脈:5.63 リンパ節:4.46 末梢血:- 脾臓:4.87 胸腺:3.80 骨髄:3.74 脂肪:5.56 骨:- 皮膚:5.28
CAGE 大脳:4.91 小脳:- 脳幹:4.84 脳梁:4.81 松果体:3.74 末梢神経:- 脊柱:5.19 網膜:- 目:- 動脈:4.31 静脈:4.04 リンパ節:3.83 末梢血:- 脾臓:4.00 胸腺:3.40 骨髄:- 脂肪:4.07 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:6.60 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:4.53 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:4.99 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:36.50 胎盤:69.20 前立腺:56.30 卵巣:298.10 精巣:77.90 心臓:25.50 骨格筋:40.20 食道:- 胃:42.50 腸:324 結腸:330.70     肝臓:31.70        肺:53.80    膀胱:- 腎臓:93.60 下垂体:116 甲状腺:- 副腎:253.90 膵臓:62.20 乳腺:46.50 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.02 胎盤:5.10 前立腺:6.53 卵巣:6.61 精巣:4.93 心臓:4.96 骨格筋:4.16 食道:4.80 胃:4.75 腸:5.08 結腸:5.31 肝臓:3.55 肺:5.24 膀胱:- 腎臓:5.68 下垂体:6.56 甲状腺:5.94 副腎:5.37 膵臓:5.14 乳腺:5.47 唾液腺:4.35
CAGE 子宮:4.00 胎盤:4.29 前立腺:4.34 卵巣:4.20 精巣:3.67 心臓:4.15 骨格筋:3.34 食道:3.99 胃:- 腸:5.18 結腸:5.12     肝臓:3.86    肺:4.24 膀胱:3.98 腎臓:4.30 下垂体:4.29 甲状腺:4.24 副腎:- 膵臓:4.10 乳腺:4.24 唾液腺:3.48
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:5.27 卵巣:5.51 精巣:5.02 心臓:3.75 骨格筋:1.84 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:5.27     肝臓:2.95        肺:5.46    膀胱:- 腎臓:5.22 下垂体:- 甲状腺:5.01 副腎:4.77 膵臓:- 乳腺:4.79 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_003130
Gene ID 6717
Unigene ID Hs.489040
Probe set ID 208920_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000075142
GTEx ID ENSG00000075142

オーソログ対応遺伝子

マウス[4]  NM_001080974, NM_025618
ラット[4]  NM_001080974, NM_025618

染色体

7q21.12  [87,834,433  -  87,856,308]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR002048  Calcium-binding EF-hand
IPR018249  EF-HAND 2

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1286667
2901906
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7835417
7873602
8561500
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10672515
10748169
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12411058
12477932
12754254
12804766
15231748
15326289
15489334
15808837
15862967
16130169
16169070
16189514
16320026
16341674
16344560
16931553
16934756
17130302
17215369
17541155
17643375
17699613
17893145
18315902
18423116
18624398
19738201
19885748
19913121
20012234
20628086
20647321
20858460
20972266
21109982
21139048
21890473
21906983
21963094
21979464
21988832
22052463
22053931
22338092
22623428
22701893
23000965
23602568
24013575
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006816  calcium ion transport
GO:0042994  cytoplasmic sequestering of transcription factor
GO:0007507  heart development
GO:0006880  intracellular sequestering of iron ion
GO:0007517  muscle organ development
GO:0010459  negative regulation of heart rate
GO:0060315  negative regulation of ryanodine-sensitive calcium-release channel activity
GO:0051281  positive regulation of release of sequestered calcium ion into cytosol
GO:0001508  regulation of action potential
GO:0051924  regulation of calcium ion transport
GO:0010649  regulation of cell communication by electrical coupling
GO:0008016  regulation of heart contraction
GO:0010880  regulation of release of sequestered calcium ion into cytosol by sarcoplasmic reticulum
GO:0006942  regulation of striated muscle contraction
GO:0007165  signal transduction
GO:0006810  transport

Cellular Component

GO:0042584  chromaffin granule membrane
GO:0005737  cytoplasm
GO:0005829  cytosol
GO:0005789  endoplasmic reticulum membrane
GO:0016020  membrane
GO:0016529  sarcoplasmic reticulum
GO:0033017  sarcoplasmic reticulum membrane
GO:0030315  T-tubule
GO:0030018  Z disc

Molecular Function

GO:0005246  calcium channel regulator activity
GO:0005509  calcium ion binding
GO:0002020  protease binding
GO:0005515  protein binding
GO:0046982  protein heterodimerization activity
GO:0005102  receptor binding
GO:0070491  transcription repressor binding