structure specific recognition protein 1

同義遺伝子名

hSSRP1, structure specific recognition protein 1, Structure-specific recognition protein 1, FACT, T160, FACT80, SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, FACT 80 kDa subunit, FACTp80

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:45

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:237.30

目:99.90

動脈:30

静脈:133.30

リンパ節:202.20

末梢血:72.90

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:59

脂肪:40.30

骨:12.80

皮膚:52.80

GeneChip

大脳:7.14

小脳:7.25

脳幹:7.17

脳梁:7

松果体:-

末梢神経:7.16

脊柱:6.95

網膜:-

目:-

動脈:7.39

静脈:7.23

リンパ節:7.66

末梢血:-

脾臓:7.34

胸腺:7.91

骨髄:7.59

脂肪:7.33

骨:-

皮膚:7.66

CAGE

大脳:3.15

小脳:-

脳幹:3.14

脳梁:3.20

松果体:2.89

末梢神経:-

脊柱:3.03

網膜:-

目:-

動脈:3.17

静脈:3.55

リンパ節:3.65

末梢血:-

脾臓:3.39

胸腺:3.78

骨髄:-

脂肪:3.37

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:4.36

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:4.99

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:5.24

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:27.30

胎盤:80.10

前立腺:123.90

卵巣:149.10

精巣:99.50

心臓:51.10

骨格筋:-

食道:-

胃:42.50

腸:32.40

結腸:76.30

肝臓:73.90

肺:53.80

膀胱:-

腎臓:52

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:17.80

乳腺:92.90

唾液腺:-

GeneChip

子宮:7.55

胎盤:7.55

前立腺:7.63

卵巣:7.84

精巣:7.83

心臓:6.95

骨格筋:7.07

食道:7.51

胃:7.33

腸:7.30

結腸:7.55

肝臓:7.07

肺:7.44

膀胱:-

腎臓:7.29

下垂体:7.66

甲状腺:7.76

副腎:7.32

膵臓:7.28

乳腺:7.62

唾液腺:7.67

CAGE

子宮:3.50

胎盤:3.65

前立腺:3.52

卵巣:3.90

精巣:3.66

心臓:3.51

骨格筋:3.65

食道:3.62

胃:-

腸:3.30

結腸:3.51

肝臓:3.30

肺:3.28

膀胱:3.49

腎臓:3.16

下垂体:3.39

甲状腺:3.94

副腎:-

膵臓:3.77

乳腺:3.90

唾液腺:3.57

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:5.29

卵巣:5.97

精巣:5.78

心臓:3.59

骨格筋:6.34

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:5.20

肝臓:4.17

肺:4.95

膀胱:-

腎臓:4.83

下垂体:-

甲状腺:5.75

副腎:5.49

膵臓:-

乳腺:4.39

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_003146
Gene ID	6749
Unigene ID	Hs.523680
Probe set ID	200957_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000149136
GTEx ID	ENSG00000149136

オーソログ対応遺伝子

マウス[6]	NM_001136081, NM_182990
ラット [0]

染色体

11q12.1 [57,093,459 - 57,103,351]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000910	High mobility group, HMG1/HMG2
IPR000135	High mobility group, HMG1/HMG2, subgroup
IPR009071	High mobility group, superfamily

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0006281	DNA repair
GO:0006260	DNA replication
GO:0010467	gene expression
GO:0050434	positive regulation of viral transcription
GO:0006355	regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006368	RNA elongation from RNA polymerase II promoter
GO:0006366	transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0016032	viral reproduction

Cellular Component

GO:0005694	chromosome
GO:0005737	cytoplasm
GO:0005730	nucleolus
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0003682	chromatin binding
GO:0003677	DNA binding
GO:0005515	protein binding

structure specific recognition protein 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function