synovial sarcoma translocation, chromosome 18

同義遺伝子名

SYT protein, synovial sarcoma translocation, chromosome 18, SYT, SS18, Synovial sarcoma, translocated to X chromosome, MGC116875, SSXT, SSXT protein

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:34.40

小脳:37.80

脳幹:-

脳梁:58.30

松果体:-

末梢神経:184

脊柱:-

網膜:118.60

目:23.50

動脈:60

静脈:66.60

リンパ節:40.40

末梢血:18.20

脾臓:37.80

胸腺:90.20

骨髄:19.70

脂肪:40.30

骨:64

皮膚:115.20

GeneChip

大脳:4.64

小脳:4.30

脳幹:4.81

脳梁:5.58

松果体:-

末梢神経:5.40

脊柱:5.49

網膜:-

目:-

動脈:4.84

静脈:4.99

リンパ節:5.54

末梢血:-

脾臓:5.36

胸腺:6.41

骨髄:4.50

脂肪:4.78

骨:-

皮膚:5.74

CAGE

大脳:4.18

小脳:-

脳幹:4.40

脳梁:4.59

松果体:4.31

末梢神経:-

脊柱:4.46

網膜:-

目:-

動脈:4.72

静脈:4.53

リンパ節:4.44

末梢血:-

脾臓:4.32

胸腺:4.27

骨髄:-

脂肪:4.42

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.34

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:1.43

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:1.53

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:63.80

胎盤:80.10

前立腺:56.30

卵巣:186.30

精巣:51.90

心臓:25.50

骨格筋:20.10

食道:-

胃:106.20

腸:64.80

結腸:84.80

肝臓:42.20

肺:58.70

膀胱:125.60

腎臓:31.20

下垂体:116

甲状腺:-

副腎:50.80

膵臓:62.20

乳腺:111.50

唾液腺:328.40

GeneChip

子宮:6.09

胎盤:6.35

前立腺:6.21

卵巣:6.52

精巣:4.99

心臓:4.68

骨格筋:3.74

食道:5.56

胃:4.99

腸:4.89

結腸:4.65

肝臓:4.46

肺:5.32

膀胱:-

腎臓:5.30

下垂体:5.36

甲状腺:5.38

副腎:5.56

膵臓:4.21

乳腺:5.76

唾液腺:4.85

CAGE

子宮:4.51

胎盤:4.79

前立腺:4.29

卵巣:4.60

精巣:4.42

心臓:4.24

骨格筋:3.49

食道:4.39

胃:-

腸:3.95

結腸:3.97

肝臓:4.33

肺:4.26

膀胱:4.21

腎臓:4.46

下垂体:4.96

甲状腺:4.36

副腎:-

膵臓:3.90

乳腺:4.35

唾液腺:4.32

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:3.09

卵巣:3.99

精巣:3.32

心臓:2.33

骨格筋:1.36

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:1.96

肝臓:1.28

肺:1.83

膀胱:-

腎臓:2.13

下垂体:-

甲状腺:2.44

副腎:2.49

膵臓:-

乳腺:1.72

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001007559
Gene ID	6760
Unigene ID	Hs.404263
Probe set ID	202817_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000141380
GTEx ID	ENSG00000141380

オーソログ対応遺伝子

マウス[12]	NM_001161369, NM_001161370, NM_009280
ラット[1]	NM_001100900, NM_001161370, NM_009280

染色体

18q11.2 [23,596,219 - 23,671,164]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

GO:0000902	cell morphogenesis
GO:0048013	ephrin receptor signaling pathway
GO:0000226	microtubule cytoskeleton organization
GO:0045944	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0007243	protein kinase cascade
GO:0042493	response to drug
GO:0006351	transcription, DNA-dependent

GO:0005881	cytoplasmic microtubule
GO:0005634	nucleus

GO:0030374	ligand-dependent nuclear receptor transcription coactivator activity
GO:0005515	protein binding

synovial sarcoma translocation, chromosome 18

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function