striatin, calmodulin binding protein

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同義遺伝子名

STRN, MGC125642, Striatin, striatin, calmodulin binding protein, SG2NA

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:4.40 小脳:4.31 脳幹:4.45 脳梁:4.47 松果体:- 末梢神経:4.31 脊柱:4.52 網膜:- 目:- 動脈:4.22 静脈:4.57 リンパ節:4.13 末梢血:- 脾臓:4.22 胸腺:4.49 骨髄:4.60 脂肪:4.29 骨:- 皮膚:4.26
CAGE 大脳:3.91 小脳:- 脳幹:4.45 脳梁:4.63 松果体:2.88 末梢神経:- 脊柱:4.61 網膜:- 目:- 動脈:3.38 静脈:3.20 リンパ節:3.40 末梢血:- 脾臓:3.29 胸腺:3.55 骨髄:- 脂肪:3.38 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:3.03 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.08 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.46 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:4.13 胎盤:4.68 前立腺:4.15 卵巣:4.05 精巣:4.22 心臓:4.45 骨格筋:4.54 食道:4.47 胃:4.37 腸:4.37 結腸:4.65 肝臓:4.15 肺:4.19 膀胱:- 腎臓:4.24 下垂体:4.20 甲状腺:4.11 副腎:4.28 膵臓:4.45 乳腺:4.07 唾液腺:4.30
CAGE 子宮:3.40 胎盤:3.34 前立腺:3.17 卵巣:3.06 精巣:3.18 心臓:3.85 骨格筋:3.20 食道:3.86 胃:- 腸:3.48 結腸:3.47     肝臓:2.66    肺:3.53 膀胱:3.35 腎臓:3.11 下垂体:2.86 甲状腺:2.52 副腎:- 膵臓:2.54 乳腺:3.62 唾液腺:3.29
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:2.18 卵巣:2.06 精巣:2.35 心臓:2.83 骨格筋:2.20 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.13     肝臓:1.09        肺:1.94    膀胱:- 腎臓:2.30 下垂体:- 甲状腺:2.32 副腎:1.82 膵臓:- 乳腺:2.43 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_003162
Gene ID 6801
Unigene ID -
Probe set ID 205520_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000115808
GTEx ID ENSG00000115808

オーソログ対応遺伝子

マウス[4]  NM_011500
ラット [0]  

染色体

2p22.2  [37,070,783  -  37,193,615]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR020472  G-protein beta WD-40 repeat, region
IPR001680  WD40 repeat
IPR019782  WD40 repeat 2
IPR019781  WD40 repeat, subgroup
IPR011046  WD40 repeat-like-containing domain
IPR017986  WD40-repeat-containing domain
IPR015943  WD40/YVTN repeat-like-containing domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8769426
9693043
10681496
10748158
11707266
12153137
12477932
15231748
15489334
15569929
15815621
17353931
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17975119
18029348
18502210
18571342
18782753
19023099
19156129
19165527
19322201
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21139048
21890473
21985334
22889411
22939629
22990118
23277359
23455922
24255178
24613930
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0016358  dendrite development
GO:0007626  locomotory behavior
GO:0008285  negative regulation of cell proliferation
GO:0070830  tight junction assembly
GO:0016055  Wnt receptor signaling pathway

Cellular Component

GO:0043025  cell soma
GO:0005737  cytoplasm
GO:0043197  dendritic spine
GO:0016020  membrane
GO:0014069  postsynaptic density
GO:0045211  postsynaptic membrane
GO:0000159  protein phosphatase type 2A complex
GO:0005923  tight junction

Molecular Function

GO:0070016  armadillo repeat domain binding
GO:0005516  calmodulin binding
GO:0030331  estrogen receptor binding
GO:0005515  protein binding
GO:0032403  protein complex binding
GO:0051721  protein phosphatase 2A binding