suppressor of Ty 4 homolog 1 (S. cerevisiae)

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同義遺伝子名

suppressor of Ty 4 homolog 1 (S. cerevisiae), hSPT4, SPT4H, DRB sensitivity-inducing factor small subunit, SUPT4H, SUPT4H1, DSIF p14, suppressor of Ty (S.cerevisiae) 4 homolog 1, DSIF small subunit, Transcription elongation factor SPT4

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:59.30 小脳:25.20 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:94 動脈:149.90 静脈:66.60 リンパ節:91 末梢血:164 脾臓:18.90 胸腺:38.70 骨髄:78.70 脂肪:282.30 骨:51.20 皮膚:76.80
GeneChip 大脳:7.26 小脳:7.42 脳幹:7.27 脳梁:6.85 松果体:- 末梢神経:7.51 脊柱:6.96 網膜:- 目:- 動脈:6.99 静脈:7.32 リンパ節:7.10 末梢血:- 脾臓:7.08 胸腺:6.90 骨髄:7.63 脂肪:7.10 骨:- 皮膚:7.01
CAGE 大脳:3.96 小脳:- 脳幹:3.92 脳梁:3.96 松果体:3.24 末梢神経:- 脊柱:3.65 網膜:- 目:- 動脈:3.84 静脈:4.16 リンパ節:4.10 末梢血:- 脾臓:4.20 胸腺:4.17 骨髄:- 脂肪:4.10 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:4.68 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:5.23 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:4.23 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:72.90 胎盤:83.80 前立腺:101.40 卵巣:260.80 精巣:38.90 心臓:127.70 骨格筋:60.30 食道:- 胃:42.50 腸:97.20 結腸:76.30     肝臓:42.20        肺:97.80    膀胱:- 腎臓:72.80 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:152.40 膵臓:88.90 乳腺:92.90 唾液腺:-
GeneChip 子宮:7.09 胎盤:6.92 前立腺:7.30 卵巣:7.47 精巣:7.47 心臓:6.94 骨格筋:7.79 食道:7.20 胃:6.99 腸:7 結腸:7.07 肝臓:6.78 肺:7.17 膀胱:- 腎臓:7.53 下垂体:6.97 甲状腺:7.37 副腎:7.35 膵臓:6.86 乳腺:7.40 唾液腺:7.17
CAGE 子宮:4.20 胎盤:4.21 前立腺:4.10 卵巣:4.09 精巣:4.35 心臓:3.69 骨格筋:3.98 食道:4.15 胃:- 腸:4.12 結腸:4.04     肝臓:4.33    肺:4.00 膀胱:4.05 腎臓:4.29 下垂体:3.55 甲状腺:4.30 副腎:- 膵臓:3.99 乳腺:3.71 唾液腺:4.23
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:5.27 卵巣:4.79 精巣:4.94 心臓:4.28 骨格筋:4.05 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:4.78     肝臓:4.61        肺:4.87    膀胱:- 腎臓:4.81 下垂体:- 甲状腺:4.85 副腎:5.06 膵臓:- 乳腺:4.50 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_003168
Gene ID 6827
Unigene ID Hs.439481
Probe set ID 201484_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000213246
GTEx ID ENSG00000213246

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_009296, NM_011509
ラット[1]  NM_001105828, NM_011509

染色体

17q22  [56,422,539  -  56,429,563]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR009287  Transcription initiation Spt4
IPR016046  Transcription initiation Spt4-like

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

7566098
8649394
8786137
9450929
9857195
10075709
10199401
10454543
10757782
10912001
11112772
11553615
12391174
12477932
12612062
12653964
12676794
12718890
14702039
15060154
15136722
15342556
15380072
15489334
16169070
16214896
17502349
17962196
18373978
19210550
19860741
19952111
20211142
21139048
21832049
21890473
21900206
21906983
22422068
22505724
22570620
22939629
23000965
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006338  chromatin remodeling
GO:0010467  gene expression
GO:0032785  negative regulation of RNA elongation
GO:0034244  negative regulation of RNA elongation from RNA polymerase II promoter
GO:0000122  negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0032786  positive regulation of RNA elongation
GO:0045944  positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0050434  positive regulation of viral transcription
GO:0006357  regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006368  RNA elongation from RNA polymerase II promoter
GO:0006366  transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0016032  viral reproduction

Cellular Component

GO:0032044  DSIF complex
GO:0005654  nucleoplasm
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0005515  protein binding
GO:0046982  protein heterodimerization activity
GO:0003700  transcription factor activity
GO:0008270  zinc ion binding