chemokine (C motif) ligand 2

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同義遺伝子名

SCYC2, SCM-1b, chemokine (C motif) ligand 2, XC chemokine ligand 2, Cytokine SCM-1 beta precursor, SCM1B, XCL2

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:-

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

GeneChip

大脳:4.26

小脳:4.60

脳幹:4.31

脳梁:4.22

松果体:-

末梢神経:4.34

脊柱:4.36

網膜:-

目:-

動脈:4.84

静脈:5.04

リンパ節:5.86

末梢血:-

脾臓:8.07

胸腺:5.70

骨髄:5.63

脂肪:5.05

骨:-

皮膚:5.04

CAGE

大脳:0

小脳:-

脳幹:0.06

脳梁:0.07

松果体:0

末梢神経:-

脊柱:0.13

網膜:-

目:-

動脈:1.22

静脈:2.11

リンパ節:1.05

末梢血:-

脾臓:2.27

胸腺:1.73

骨髄:-

脂肪:0.46

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:2.01

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.19

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:-

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:5.13

胎盤:5.41

前立腺:4.35

卵巣:4.99

精巣:4.02

心臓:4.80

骨格筋:4.49

食道:4.57

胃:4.81

腸:4.90

結腸:4.96

肝臓:5.65

肺:5.43

膀胱:-

腎臓:4.38

下垂体:4.20

甲状腺:4.58

副腎:4.31

膵臓:4.57

乳腺:4.73

唾液腺:4.82

CAGE

子宮:0.94

胎盤:1.39

前立腺:0.81

卵巣:0.20

精巣:0.10

心臓:0.56

骨格筋:0.05

食道:0.40

胃:-

腸:1.05

結腸:0.84

肝臓:0.78

肺:1.58

膀胱:0.69

腎臓:0.49

下垂体:0

甲状腺:0.32

副腎:-

膵臓:0.58

乳腺:0.90

唾液腺:1.28

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.93

卵巣:0.70

精巣:0.28

心臓:0.16

骨格筋:0

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0

肝臓:0.27

肺:2.37

膀胱:-

腎臓:0.37

下垂体:-

甲状腺:0.34

副腎:2.03

膵臓:-

乳腺:0.35

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_003175
Gene ID	6846
Unigene ID	Hs.458346
Probe set ID	214567_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000143185
GTEx ID	ENSG00000143185

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_008510
ラット [0]

染色体

1q24.2 [168,510,003 - 168,513,235]

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- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR008105	Lymphotactin precursor
IPR001811	Small chemokine, interleukin-8-like

Link to Pubmed (Pubmed ID)

7875320
8849694
9632725
11181995
12477932
15340161
15489334
16710414
16754659
17763208
18618175

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0008015	blood circulation
GO:0006935	chemotaxis
GO:0006955	immune response
GO:0007165	signal transduction

Cellular Component

GO:0005576	extracellular region
GO:0005615	extracellular space

Molecular Function

chemokine activity