synaptophysin

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同義遺伝子名

synaptophysin, SYP, Synaptophysin, Major synaptic vesicle protein p38

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:246.50

小脳:340

脳幹:-

脳梁:145.80

松果体:593.40

末梢神経:-

脊柱:224.60

網膜:474.60

目:99.90

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:18.20

脾臓:-

胸腺:77.30

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

GeneChip

大脳:8.05

小脳:8.26

脳幹:7.78

脳梁:7.07

松果体:-

末梢神経:7.52

脊柱:7.16

網膜:-

目:-

動脈:6.07

静脈:6.55

リンパ節:6.11

末梢血:-

脾臓:5.99

胸腺:5.75

骨髄:6.47

脂肪:6.08

骨:-

皮膚:5.90

CAGE

大脳:5.84

小脳:-

脳幹:4.88

脳梁:4.68

松果体:6.80

末梢神経:-

脊柱:4.39

網膜:-

目:-

動脈:2.28

静脈:1.76

リンパ節:0.79

末梢血:-

脾臓:0.95

胸腺:2.15

骨髄:-

脂肪:1.29

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:7.64

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.76

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:1.01

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:3.60

前立腺:-

卵巣:-

精巣:8.70

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:25.40

肝臓:21.10

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:35.60

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:5.79

胎盤:6.43

前立腺:5.41

卵巣:5.81

精巣:5.47

心臓:6.15

骨格筋:6.28

食道:5.84

胃:6.29

腸:6.51

結腸:6.22

肝臓:6.47

肺:6.24

膀胱:-

腎臓:6.05

下垂体:7.92

甲状腺:5.79

副腎:6.27

膵臓:7.10

乳腺:5.85

唾液腺:6.26

CAGE

子宮:1.31

胎盤:0.48

前立腺:1.36

卵巣:0.76

精巣:1.65

心臓:1.29

骨格筋:0.55

食道:1.31

胃:-

腸:2.98

結腸:2.58

肝臓:0.55

肺:1.64

膀胱:1.09

腎臓:1.77

下垂体:5.23

甲状腺:0.95

副腎:-

膵臓:2.60

乳腺:0

唾液腺:1.15

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:1.56

卵巣:1.01

精巣:1.20

心臓:0.69

骨格筋:0.62

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.84

肝臓:0.28

肺:1.17

膀胱:-

腎臓:1.59

下垂体:-

甲状腺:1.05

副腎:0.92

膵臓:-

乳腺:0.98

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_003179
Gene ID	6855
Unigene ID	Hs.632804
Probe set ID	213200_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000102003
GTEx ID	ENSG00000102003

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_009305
ラット [0]

染色体

Xp11.23 [49,044,269 - 49,056,718]

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- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR008253	Marvel
IPR021128	MARVEL-like domain
IPR001285	Synaptophysin/synaptoporin

GO:0071310	cellular response to organic substance
GO:0006897	endocytosis
GO:0048169	regulation of long-term neuronal synaptic plasticity
GO:0048172	regulation of short-term neuronal synaptic plasticity
GO:0016188	synaptic vesicle maturation
GO:0048499	synaptic vesicle membrane organization

GO:0030054	cell junction
GO:0060076	excitatory synapse
GO:0030285	integral to synaptic vesicle membrane
GO:0048786	presynaptic active zone
GO:0042734	presynaptic membrane
GO:0043234	protein complex

GO:0005509	calcium ion binding
GO:0015485	cholesterol binding
GO:0042802	identical protein binding
GO:0032403	protein complex binding
GO:0042169	SH2 domain binding
GO:0017075	syntaxin-1 binding
GO:0005215	transporter activity

synaptophysin

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function