TAF5 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, 100kDa

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同義遺伝子名

TAF5, TAFII-100, TAF(II)100, Transcription initiation factor TFIID subunit 5, TAF2D, TAFII100

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:5.90 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:40.40 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
GeneChip 大脳:4.96 小脳:5.53 脳幹:4.98 脳梁:5.02 松果体:- 末梢神経:5.08 脊柱:4.82 網膜:- 目:- 動脈:5.20 静脈:5.10 リンパ節:5.44 末梢血:- 脾臓:5.51 胸腺:6.27 骨髄:6.12 脂肪:4.99 骨:- 皮膚:5.41
CAGE 大脳:1.92 小脳:- 脳幹:1.76 脳梁:1.73 松果体:1.82 末梢神経:- 脊柱:1.86 網膜:- 目:- 動脈:1.16 静脈:1.83 リンパ節:1.75 末梢血:- 脾臓:1.65 胸腺:2.58 骨髄:- 脂肪:1.99 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.90 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.98 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:1.28 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:11.30 卵巣:- 精巣:34.60 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:32.40 結腸:-     肝臓:10.60        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:5.44 胎盤:5.62 前立腺:5.08 卵巣:5.22 精巣:7.11 心臓:4.92 骨格筋:5.13 食道:4.93 胃:5.15 腸:4.95 結腸:4.93 肝臓:4.91 肺:5.31 膀胱:- 腎臓:4.73 下垂体:5.20 甲状腺:5.29 副腎:4.79 膵臓:4.46 乳腺:5.19 唾液腺:4.76
CAGE 子宮:1.79 胎盤:1.68 前立腺:1.74 卵巣:1.44 精巣:3.18 心臓:1.53 骨格筋:1.46 食道:1.41 胃:- 腸:1.76 結腸:2.10     肝臓:1.74    肺:1.65 膀胱:1.66 腎臓:1.30 下垂体:1.97 甲状腺:1.68 副腎:- 膵臓:2.08 乳腺:2.11 唾液腺:1.15
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:1.78 卵巣:1.48 精巣:3.86 心臓:0.98 骨格筋:1.31 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.90     肝臓:1.15        肺:1.18    膀胱:- 腎臓:1.36 下垂体:- 甲状腺:1.28 副腎:0.99 膵臓:- 乳腺:1.15 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_006951
Gene ID 6877
Unigene ID Hs.96103
Probe set ID 210053_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000148835
GTEx ID ENSG00000148835

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_177342
ラット[1]  NM_001106365

染色体

10q24.33  [105,127,724  -  105,148,822]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR020472  G-protein beta WD-40 repeat, region
IPR006594  LisH dimerisation motif
IPR001680  WD40 repeat
IPR019782  WD40 repeat 2
IPR019781  WD40 repeat, subgroup
IPR011046  WD40 repeat-like-containing domain
IPR017986  WD40-repeat-containing domain
IPR015943  WD40/YVTN repeat-like-containing domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1939271
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9603525
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10373431
10523658
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11564863
12477932
12601814
12660246
14580349
15053879
15489334
15637059
15870280
15899866
17227857
17375202
17643375
17884155
17967894
17996705
18029348
19240132
20953165
21145461
21729782
22323595
22696218
22834489
22939629
23827503
23974872
24250222
24489103

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0016568  chromatin modification
GO:0010467  gene expression
GO:0016573  histone acetylation
GO:0006368  RNA elongation from RNA polymerase II promoter
GO:0006366  transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006352  transcription initiation
GO:0006367  transcription initiation from RNA polymerase II promoter
GO:0016032  viral reproduction
GO:0019048  virus-host interaction

Cellular Component

GO:0015629  actin cytoskeleton
GO:0043231  intracellular membrane-bounded organelle
GO:0005730  nucleolus
GO:0005654  nucleoplasm
GO:0005634  nucleus
GO:0005669  transcription factor TFIID complex
GO:0033276  transcription factor TFTC complex

Molecular Function

GO:0044212  DNA regulatory region binding
GO:0004402  histone acetyltransferase activity
GO:0005515  protein binding
GO:0046983  protein dimerization activity
GO:0003700  transcription factor activity