TAR (HIV-1) RNA binding protein 2

同義遺伝子名

TRBP1, Trans-activation-responsive RNA-binding protein, TAR (HIV) RNA-binding protein 2, TRBP2, Tar (HIV) RNA binding protein 2, TARBP2, Tar (HIV-1) RNA binding protein 2, TAR RNA-binding protein 2

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

nodata

GeneChip

大脳:5.93

小脳:6.99

脳幹:5.97

脳梁:6

松果体:-

末梢神経:6.14

脊柱:5.86

網膜:-

目:-

動脈:6.24

静脈:5.93

リンパ節:6.42

末梢血:-

脾臓:6.33

胸腺:6.43

骨髄:6.30

脂肪:6.17

骨:-

皮膚:6.39

CAGE

大脳:1.71

小脳:-

脳幹:1.80

脳梁:2.13

松果体:1.59

末梢神経:-

脊柱:1.42

網膜:-

目:-

動脈:1.94

静脈:2.03

リンパ節:2.36

末梢血:-

脾臓:2.00

胸腺:2.22

骨髄:-

脂肪:1.74

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.69

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.83

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.73

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

nodata

GeneChip

子宮:6.25

胎盤:6.57

前立腺:6.19

卵巣:6.24

精巣:6.62

心臓:5.89

骨格筋:6.17

食道:6.31

胃:6.17

腸:6.33

結腸:6.15

肝臓:6.43

肺:6.30

膀胱:-

腎臓:6.46

下垂体:6.38

甲状腺:6.65

副腎:6.39

膵臓:6.31

乳腺:6.46

唾液腺:6.27

CAGE

子宮:1.98

胎盤:2.72

前立腺:1.94

卵巣:2.02

精巣:2.62

心臓:1.47

骨格筋:0.87

食道:2.16

胃:-

腸:2.05

結腸:1.78

肝臓:2.78

肺:2.05

膀胱:1.30

腎臓:2.22

下垂体:1.51

甲状腺:2.34

副腎:-

膵臓:2.18

乳腺:2.64

唾液腺:2.26

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:1.26

卵巣:1.62

精巣:1.70

心臓:0.78

骨格筋:0.24

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.98

肝臓:1.23

肺:0.84

膀胱:-

腎臓:1.49

下垂体:-

甲状腺:1.98

副腎:1.76

膵臓:-

乳腺:1.36

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_134323
Gene ID	6895
Unigene ID	-
Probe set ID	203677_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000139546
GTEx ID	ENSG00000139546

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_009319
ラット[2]	NM_009319

染色体

12q13.13 [53,894,705 - 53,900,215]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001159	Double-stranded RNA binding
IPR014720	Double-stranded RNA-binding-like

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0010467	gene expression
GO:0035280	miRNA loading onto RISC involved in gene silencing by miRNA
GO:0050689	negative regulation of defense response to virus by host
GO:0006469	negative regulation of protein kinase activity
GO:0045070	positive regulation of viral genome replication
GO:0031054	pre-microRNA processing
GO:0030422	production of siRNA involved in RNA interference
GO:0006357	regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006355	regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006417	regulation of translation
GO:0046782	regulation of viral transcription
GO:0030423	targeting of mRNA for destruction involved in RNA interference

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0005829	cytosol
GO:0005634	nucleus
GO:0048471	perinuclear region of cytoplasm
GO:0016442	RNA-induced silencing complex

Molecular Function

GO:0005515	protein binding
GO:0042803	protein homodimerization activity
GO:0035197	siRNA binding

TAR (HIV-1) RNA binding protein 2

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function