transcription elongation factor A (SII), 1

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同義遺伝子名

Transcription elongation factor TFIIS.o, TCEA1, SII, transcription elongation factor A (SII), 1, Transcription elongation factor S-II protein 1, TCEA, Transcription elongation factor A protein 1, TF2S, GTF2S

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:54.50 小脳:- 脳幹:- 脳梁:116.60 松果体:- 末梢神経:92 脊柱:112.30 網膜:- 目:76.40 動脈:30 静脈:199.90 リンパ節:141.50 末梢血:18.20 脾臓:37.80 胸腺:51.50 骨髄:98.40 脂肪:- 骨:12.80 皮膚:76.80
GeneChip 大脳:8.02 小脳:8.19 脳幹:8.13 脳梁:8.64 松果体:- 末梢神経:8.10 脊柱:8.69 網膜:- 目:- 動脈:8.30 静脈:8.60 リンパ節:8.56 末梢血:- 脾臓:8.39 胸腺:8.94 骨髄:8.55 脂肪:8.65 骨:- 皮膚:8.50
CAGE 大脳:3.35 小脳:- 脳幹:3.51 脳梁:3.45 松果体:3.85 末梢神経:- 脊柱:3.83 網膜:- 目:- 動脈:3.71 静脈:3.79 リンパ節:3.69 末梢血:- 脾臓:3.78 胸腺:3.84 骨髄:- 脂肪:3.65 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.26 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.27 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.62 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:54.70 胎盤:87.40 前立腺:67.60 卵巣:74.50 精巣:43.30 心臓:38.30 骨格筋:- 食道:- 胃:42.50 腸:97.20 結腸:135.70     肝臓:21.10        肺:78.20    膀胱:- 腎臓:10.40 下垂体:116 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:53.30 乳腺:130.10 唾液腺:-
GeneChip 子宮:8.82 胎盤:8.08 前立腺:8.95 卵巣:8.99 精巣:8.04 心臓:7.91 骨格筋:7.90 食道:8.33 胃:8.41 腸:8.45 結腸:8.07 肝臓:8.23 肺:8.43 膀胱:- 腎臓:8.12 下垂体:8.22 甲状腺:8.93 副腎:8.12 膵臓:8.62 乳腺:8.81 唾液腺:8.64
CAGE 子宮:3.51 胎盤:3.26 前立腺:3.82 卵巣:3.73 精巣:3.44 心臓:3.50 骨格筋:3.05 食道:3.61 胃:- 腸:3.44 結腸:3.45     肝臓:4.22    肺:3.74 膀胱:4.03 腎臓:3.55 下垂体:3.36 甲状腺:3.81 副腎:- 膵臓:3.95 乳腺:3.80 唾液腺:3.46
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.07 卵巣:1.11 精巣:0.24 心臓:0.09 骨格筋:0.12 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.39     肝臓:0.00        肺:0.07    膀胱:- 腎臓:1.43 下垂体:- 甲状腺:0.65 副腎:0.22 膵臓:- 乳腺:2.07 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_006756
Gene ID 6917
Unigene ID Hs.491745
Probe set ID 216241_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000187735
GTEx ID ENSG00000187735

オーソログ対応遺伝子

マウス[6]  NM_001159750, NM_001159751, NM_011541
ラット[6]  NM_001159750, NM_001159751, NM_011541

染色体

8q11.23  [54,879,112  -  54,935,089]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR017923  TFIIS N-terminal
IPR003618  Transcription elongation factor S-II, central domain
IPR017890  Transcription elongation factor S-IIM
IPR016492  Transcription elongation factor, IIS
IPR006289  Transcription elongation factor, TFIIS
IPR014765  Transcription elongation factor, TFIIS/CRSP70, N-terminal
IPR003617  Transcription elongation factor, TFIIS/CRSP70, N-terminal, sub-type
IPR010990  Transcription elongation factor, TFIIS/elongin A/CRSP70, N-terminal

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1378807
1559613
1708494
2471707
7626141
8112616
8206389
8566795
8798387
8812434
9305922
9765201
9765293
10454562
11313499
11591653
12477932
12676794
12761297
12878157
12914699
12943681
14506279
14702039
15302935
15351637
15489334
15635413
16344560
16630816
16648364
16736500
16916636
17081983
17643375
18029348
18562274
20178742
20729154
21070792
21127351
21139048
21596312
21729782
21832049
21890473
22505724
22863883
22939629
23000965
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006281  DNA repair
GO:0030218  erythrocyte differentiation
GO:0010467  gene expression
GO:0006289  nucleotide-excision repair
GO:0045944  positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0050434  positive regulation of viral transcription
GO:0032784  regulation of RNA elongation
GO:0006368  RNA elongation from RNA polymerase II promoter
GO:0006366  transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006283  transcription-coupled nucleotide-excision repair
GO:0016032  viral reproduction

Cellular Component

GO:0005730  nucleolus
GO:0005654  nucleoplasm
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0003677  DNA binding
GO:0005515  protein binding
GO:0008270  zinc ion binding