transcription elongation factor A (SII), 3

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同義遺伝子名

TCEA3, transcription elongation factor A (SII), 3, Transcription elongation factor TFIIS.h, TFIISH, TFIIS.H, Transcription elongation factor S-II protein 3, Transcription elongation factor A protein 3

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:8.30 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:61.30 脊柱:- 網膜:- 目:23.50 動脈:- 静脈:- リンパ節:40.40 末梢血:- 脾臓:37.80 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:40.30 骨:38.40 皮膚:14.40
GeneChip nodata
CAGE 大脳:1.39 小脳:- 脳幹:1.49 脳梁:1.94 松果体:2.45 末梢神経:- 脊柱:1.86 網膜:- 目:- 動脈:3.50 静脈:3.12 リンパ節:2.75 末梢血:- 脾臓:1.74 胸腺:0.64 骨髄:- 脂肪:2.79 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.74 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.89 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.00 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:9.10 胎盤:7.30 前立腺:112.60 卵巣:37.30 精巣:8.70 心臓:102.20 骨格筋:562.50 食道:- 胃:21.20 腸:64.80 結腸:25.40     肝臓:42.20        肺:34.20    膀胱:- 腎臓:62.40 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:18.60 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:3.06 胎盤:2.06 前立腺:3.98 卵巣:4.09 精巣:2.00 心臓:3.67 骨格筋:5.62 食道:3.63 胃:- 腸:3.56 結腸:3.94     肝臓:4.55    肺:2.91 膀胱:3.29 腎臓:3.51 下垂体:2.04 甲状腺:3.23 副腎:- 膵臓:5.09 乳腺:2.19 唾液腺:4.37
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:4.50 卵巣:5.42 精巣:3.02 心臓:4.51 骨格筋:7.51 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:4.11     肝臓:4.86        肺:3.15    膀胱:- 腎臓:3.94 下垂体:- 甲状腺:4.92 副腎:2.22 膵臓:- 乳腺:3.98 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_003196
Gene ID 6920
Unigene ID Hs.446354
Probe set ID -
Ensembl ID ENSG00000204219
GTEx ID ENSG00000204219

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_011542
ラット[1]  NM_001015008

染色体

1p36.12  [23,707,554  -  23,751,233]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR017923  TFIIS N-terminal
IPR003618  Transcription elongation factor S-II, central domain
IPR017890  Transcription elongation factor S-IIM
IPR016492  Transcription elongation factor, IIS
IPR006289  Transcription elongation factor, TFIIS
IPR014765  Transcription elongation factor, TFIIS/CRSP70, N-terminal
IPR003617  Transcription elongation factor, TFIIS/CRSP70, N-terminal, sub-type
IPR010990  Transcription elongation factor, TFIIS/elongin A/CRSP70, N-terminal

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1559613
9765201
9790746
12477932
15489334
19913121
20178742
20628086
21988832
23357533

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0032784  regulation of RNA elongation
GO:0006357  regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0003677  DNA binding
GO:0008270  zinc ion binding