HNF1 homeobox A

同義遺伝子名

MODY3, HNF1, Liver-specific transcription factor LF-B1, HNF-1A, Hepatocyte nuclear factor 1-alpha, TCF-1, HNF1A, LFB1, Transcription factor 1, TCF1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

nodata

GeneChip

大脳:5.71

小脳:5.99

脳幹:5.90

脳梁:5.70

松果体:-

末梢神経:5.50

脊柱:5.53

網膜:-

目:-

動脈:5.90

静脈:5.98

リンパ節:5.68

末梢血:-

脾臓:5.43

胸腺:5.71

骨髄:5.78

脂肪:5.79

骨:-

皮膚:5.85

CAGE

大脳:0

小脳:-

脳幹:0

脳梁:0

松果体:0

末梢神経:-

脊柱:0

網膜:-

目:-

動脈:0

静脈:0

リンパ節:0

末梢血:-

脾臓:0

胸腺:0

骨髄:-

脂肪:0

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.38

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.34

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.11

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

nodata

GeneChip

子宮:5.58

胎盤:5.64

前立腺:5.49

卵巣:5.70

精巣:5.65

心臓:5.75

骨格筋:5.95

食道:5.86

胃:5.63

腸:6.15

結腸:6.08

肝臓:6.20

肺:5.85

膀胱:-

腎臓:6.22

下垂体:5.84

甲状腺:5.53

副腎:5.69

膵臓:6.97

乳腺:5.58

唾液腺:5.88

CAGE

子宮:0

胎盤:0

前立腺:0

卵巣:0.07

精巣:0

心臓:0

骨格筋:0

食道:0

胃:-

腸:2.81

結腸:2.17

肝臓:2.27

肺:0

膀胱:0

腎臓:2.47

下垂体:0

甲状腺:0

副腎:-

膵臓:1.42

乳腺:0

唾液腺:0

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.32

卵巣:0.32

精巣:0.42

心臓:0.02

骨格筋:0.09

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.99

肝臓:2.65

肺:0.02

膀胱:-

腎臓:1.89

下垂体:-

甲状腺:0.08

副腎:0.20

膵臓:-

乳腺:0.14

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_000545
Gene ID	6927
Unigene ID	-
Probe set ID	210515_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000135100
GTEx ID	ENSG00000135100

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_009327
ラット [0]

染色体

12q24.31 [121,416,346 - 121,441,746]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001356	Homeobox
IPR009057	Homeodomain-like
IPR012287	Homeodomain-related

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0015721	bile acid and bile salt transport
GO:0006699	bile acid biosynthetic process
GO:0001824	blastocyst development
GO:0045453	bone resorption
GO:0008203	cholesterol metabolic process
GO:0006338	chromatin remodeling
GO:0030326	embryonic limb morphogenesis
GO:0031018	endocrine pancreas development
GO:0006633	fatty acid biosynthetic process
GO:0015908	fatty acid transport
GO:0042593	glucose homeostasis
GO:0046323	glucose import
GO:0006783	heme biosynthetic process
GO:0030073	insulin secretion
GO:0001889	liver development
GO:0000122	negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0048341	paraxial mesoderm formation
GO:0001890	placenta development
GO:0045944	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0060261	positive regulation of transcription initiation from RNA polymerase II promoter
GO:0045893	positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0008104	protein localization
GO:0050796	regulation of insulin secretion
GO:0006357	regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0030111	regulation of Wnt receptor signaling pathway
GO:0048608	reproductive structure development
GO:0009749	response to glucose stimulus
GO:0006979	response to oxidative stress
GO:0043691	reverse cholesterol transport
GO:0060395	SMAD protein signal transduction

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0005634	nucleus
GO:0001750	photoreceptor outer segment
GO:0045120	pronucleus
GO:0043234	protein complex
GO:0005667	transcription factor complex

Molecular Function

GO:0003677	DNA binding
GO:0044212	DNA regulatory region binding
GO:0003690	double-stranded DNA binding
GO:0005515	protein binding
GO:0046983	protein dimerization activity
GO:0046982	protein heterodimerization activity
GO:0042803	protein homodimerization activity
GO:0043565	sequence-specific DNA binding
GO:0003700	transcription factor activity
GO:0008134	transcription factor binding

HNF1 homeobox A

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function