Treacher Collins-Franceschetti syndrome 1

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同義遺伝子名

TCOF1, treacle, Treacher Collins-Franceschetti syndrome 1, Treacle protein, Treacher Collins syndrome protein, MFD1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:28.40

小脳:25.20

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:30.70

脊柱:-

網膜:-

目:47

動脈:30

静脈:266.60

リンパ節:151.70

末梢血:-

脾臓:37.80

胸腺:38.70

骨髄:59

脂肪:-

骨:51.20

皮膚:38.40

GeneChip

大脳:6.18

小脳:6.36

脳幹:6.05

脳梁:6.38

松果体:-

末梢神経:5.90

脊柱:5.78

網膜:-

目:-

動脈:6.25

静脈:6.25

リンパ節:6.80

末梢血:-

脾臓:6.79

胸腺:6.52

骨髄:6.20

脂肪:5.95

骨:-

皮膚:6.27

CAGE

大脳:2.66

小脳:-

脳幹:2.60

脳梁:2.40

松果体:2.54

末梢神経:-

脊柱:2.49

網膜:-

目:-

動脈:2.34

静脈:2.79

リンパ節:2.60

末梢血:-

脾臓:2.75

胸腺:2.88

骨髄:-

脂肪:2.19

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.62

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:2.24

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:1.25

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:36.50

胎盤:29.10

前立腺:33.80

卵巣:-

精巣:34.60

心臓:25.50

骨格筋:40.20

食道:-

胃:42.50

腸:-

結腸:76.30

肝臓:21.10

肺:58.70

膀胱:-

腎臓:20.80

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:111.50

唾液腺:-

GeneChip

子宮:6.46

胎盤:5.96

前立腺:5.87

卵巣:6.58

精巣:6.33

心臓:6.25

骨格筋:5.83

食道:6.44

胃:6.28

腸:6.11

結腸:6.38

肝臓:6.06

肺:6.40

膀胱:-

腎臓:5.95

下垂体:5.66

甲状腺:6

副腎:6.37

膵臓:5.99

乳腺:6.42

唾液腺:6.12

CAGE

子宮:2.54

胎盤:2.40

前立腺:2.42

卵巣:2.46

精巣:2.64

心臓:2.27

骨格筋:2.56

食道:2.35

胃:-

腸:1.98

結腸:2.70

肝臓:1.41

肺:2.32

膀胱:2.32

腎臓:1.98

下垂体:2.26

甲状腺:2.34

副腎:-

膵臓:2.34

乳腺:2.11

唾液腺:2.53

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.84

卵巣:1.16

精巣:2.09

心臓:0.67

骨格筋:0.03

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:1.22

肝臓:0.01

肺:0.61

膀胱:-

腎臓:1.92

下垂体:-

甲状腺:1.04

副腎:0.63

膵臓:-

乳腺:1.02

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001135244
Gene ID	6949
Unigene ID	Hs.519672
Probe set ID	202384_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000070814
GTEx ID	ENSG00000070814

オーソログ対応遺伝子

マウス[3]	NM_001198984, NM_011552
ラット[1]	NM_001106143, NM_011552

染色体

5q32 [149,737,202 - 149,779,870]

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- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR006594

LisH dimerisation motif

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0001501	skeletal system development
GO:0042790	transcription of nuclear rRNA large RNA polymerase I transcript

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0005730	nucleolus
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0005515	protein binding
GO:0005215	transporter activity

Treacher Collins-Franceschetti syndrome 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function