TGFB-induced factor homeobox 1

同義遺伝子名

TGFB-induced factor (TALE family homeobox), Homeobox protein TGIF, HPE4, MGC5066, MGC39747, TGIF, 5'-TG-3'-interacting factor

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:10.70

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:118.60

目:52.90

動脈:-

静脈:-

リンパ節:80.90

末梢血:18.20

脾臓:18.90

胸腺:12.90

骨髄:59

脂肪:40.30

骨:51.20

皮膚:81.60

GeneChip

大脳:4.64

小脳:3.97

脳幹:4.58

脳梁:5.79

松果体:-

末梢神経:6.09

脊柱:6.19

網膜:-

目:-

動脈:6.58

静脈:6.68

リンパ節:6.17

末梢血:-

脾臓:6.88

胸腺:6

骨髄:5.34

脂肪:6.28

骨:-

皮膚:6.69

CAGE

大脳:2.05

小脳:-

脳幹:2.10

脳梁:3.02

松果体:1.72

末梢神経:-

脊柱:2.60

網膜:-

目:-

動脈:3.64

静脈:3.05

リンパ節:2.98

末梢血:-

脾臓:3.42

胸腺:3.01

骨髄:-

脂肪:3.79

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.09

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.55

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.43

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:72.90

胎盤:91.10

前立腺:45.10

卵巣:149.10

精巣:17.30

心臓:38.30

骨格筋:20.10

食道:-

胃:42.50

腸:-

結腸:67.80

肝臓:42.20

肺:58.70

膀胱:-

腎臓:104

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:17.80

乳腺:46.50

唾液腺:-

GeneChip

子宮:7.37

胎盤:7.72

前立腺:7.80

卵巣:8.03

精巣:6.65

心臓:6.08

骨格筋:5.06

食道:6.63

胃:6.58

腸:6.67

結腸:7.41

肝臓:6.19

肺:7.41

膀胱:-

腎臓:6.76

下垂体:4.57

甲状腺:7.41

副腎:6.76

膵臓:6.25

乳腺:7.54

唾液腺:7.03

CAGE

子宮:3.76

胎盤:4.11

前立腺:3.86

卵巣:3.38

精巣:3.50

心臓:2.91

骨格筋:2.89

食道:3.60

胃:-

腸:3.10

結腸:3.35

肝臓:3.65

肺:3.64

膀胱:4.01

腎臓:3.46

下垂体:2.16

甲状腺:4.32

副腎:-

膵臓:3.23

乳腺:3.33

唾液腺:3.29

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.50

卵巣:0.40

精巣:0.25

心臓:0.07

骨格筋:0.29

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.32

肝臓:0.14

肺:0.75

膀胱:-

腎臓:0.38

下垂体:-

甲状腺:0.40

副腎:0.36

膵臓:-

乳腺:0.40

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_170695
Gene ID	7050
Unigene ID	Hs.373550
Probe set ID	203313_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000177426
GTEx ID	ENSG00000177426

オーソログ対応遺伝子

マウス[5]	NM_001164074, NM_001164075, NM_001164076, NM_001164077, NM_009372
ラット[1]	NM_001015020, NM_001164075, NM_001164076, NM_001164077, NM_009372

染色体

18p11.31 [3,411,606 - 3,459,976]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001356	Homeobox
IPR009057	Homeodomain-like
IPR012287	Homeodomain-related

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0007368	determination of left/right symmetry
GO:0009953	dorsal/ventral pattern formation
GO:0010467	gene expression
GO:0007275	multicellular organismal development
GO:0008285	negative regulation of cell proliferation
GO:0048387	negative regulation of retinoic acid receptor signaling pathway
GO:0000122	negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0001843	neural tube closure
GO:0048146	positive regulation of fibroblast proliferation
GO:0045666	positive regulation of neuron differentiation
GO:0010470	regulation of gastrulation
GO:0042493	response to drug
GO:0060041	retina development in camera-type eye
GO:0006367	transcription initiation from RNA polymerase II promoter
GO:0006351	transcription, DNA-dependent
GO:0007179	transforming growth factor beta receptor signaling pathway

Cellular Component

GO:0005654

nucleoplasm

Molecular Function

GO:0003682	chromatin binding
GO:0070410	co-SMAD binding
GO:0043565	sequence-specific DNA binding
GO:0003714	transcription corepressor activity
GO:0003700	transcription factor activity

TGFB-induced factor homeobox 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function