troponin C type 2 (fast)

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同義遺伝子名

TNNC2, Troponin C, skeletal muscle, troponin C type 2 (fast)

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:5.90 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:30.70 脊柱:- 網膜:- 目:17.60 動脈:209.80 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:12.90 骨髄:- 脂肪:5606.40 骨:- 皮膚:52.80
GeneChip 大脳:5.27 小脳:5.30 脳幹:5.14 脳梁:4.87 松果体:- 末梢神経:4.93 脊柱:4.87 網膜:- 目:- 動脈:5.28 静脈:5.53 リンパ節:5.15 末梢血:- 脾臓:4.84 胸腺:4.91 骨髄:5.15 脂肪:5.50 骨:- 皮膚:6.87
CAGE 大脳:0.02 小脳:- 脳幹:0 脳梁:0.07 松果体:0.36 末梢神経:- 脊柱:0 網膜:- 目:- 動脈:1.57 静脈:4.78 リンパ節:2.26 末梢血:- 脾臓:0 胸腺:0.37 骨髄:- 脂肪:5.14 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.05 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.59 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.60 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:10.90 前立腺:33.80 卵巣:- 精巣:4.30 心臓:38.30 骨格筋:6328.50 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:31.70        肺:39.10    膀胱:- 腎臓:10.40 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:50.80 膵臓:71.10 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:5.06 胎盤:4.80 前立腺:4.86 卵巣:5.15 精巣:5.41 心臓:5.16 骨格筋:13.23 食道:9.22 胃:5.02 腸:6.55 結腸:5.47 肝臓:4.75 肺:5.30 膀胱:- 腎臓:5 下垂体:5.27 甲状腺:5.63 副腎:5.31 膵臓:5.30 乳腺:5.10 唾液腺:5.46
CAGE 子宮:0.15 胎盤:0 前立腺:1.23 卵巣:0.07 精巣:0.54 心臓:0.11 骨格筋:8.72 食道:4.06 胃:- 腸:0 結腸:0.04     肝臓:0    肺:0 膀胱:0.69 腎臓:0.08 下垂体:0 甲状腺:3.14 副腎:- 膵臓:0.58 乳腺:0 唾液腺:2.93
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:1.81 卵巣:1.53 精巣:3.73 心臓:0.14 骨格筋:9.90 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.55     肝臓:0.07        肺:1.40    膀胱:- 腎臓:0.12 下垂体:- 甲状腺:8.18 副腎:0.39 膵臓:- 乳腺:8.32 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_003279
Gene ID 7125
Unigene ID Hs.182421
Probe set ID 205388_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000101470
GTEx ID ENSG00000101470

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_009394
ラット [0]  

染色体

20q13.12  [44,451,853  -  44,462,384]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR002048  Calcium-binding EF-hand
IPR018249  EF-HAND 2

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

978749
1907279
2373703
3166492
7869399
9016781
9459007
9560191
11780052
12477932
15489334
17194691
19460752
19913121
20628086

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0030049  muscle filament sliding
GO:0006937  regulation of muscle contraction
GO:0003009  skeletal muscle contraction

Cellular Component

GO:0005829  cytosol
GO:0005861  troponin complex

Molecular Function

GO:0003779  actin binding
GO:0005509  calcium ion binding