troponin C type 1 (slow)

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同義遺伝子名

Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, TNNC1, TNNC, TN-C, troponin C type 1 (slow), TNC

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:-

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:148.30

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:118.60

目:35.30

動脈:30

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:18.20

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:1008.30

骨:-

皮膚:43.20

GeneChip

大脳:3.78

小脳:3.94

脳幹:3.71

脳梁:3.65

松果体:-

末梢神経:6.06

脊柱:3.78

網膜:-

目:-

動脈:5.55

静脈:7.38

リンパ節:3.87

末梢血:-

脾臓:3.60

胸腺:3.71

骨髄:3.79

脂肪:4.08

骨:-

皮膚:6.05

CAGE

大脳:0.18

小脳:-

脳幹:0.42

脳梁:0.43

松果体:0.36

末梢神経:-

脊柱:1.83

網膜:-

目:-

動脈:2.28

静脈:4.90

リンパ節:2.77

末梢血:-

脾臓:0.25

胸腺:0.37

骨髄:-

脂肪:3.74

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.19

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:3.52

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.93

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:3.60

前立腺:67.60

卵巣:-

精巣:-

心臓:1698.60

骨格筋:2551.50

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:8.50

肝臓:10.60

肺:63.50

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:101.60

膵臓:17.80

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:4.07

胎盤:3.71

前立腺:4.51

卵巣:3.84

精巣:4.25

心臓:10.18

骨格筋:12.25

食道:8.47

胃:3.75

腸:5.53

結腸:3.97

肝臓:3.80

肺:6.62

膀胱:-

腎臓:4.24

下垂体:4.34

甲状腺:4.50

副腎:4.79

膵臓:4.17

乳腺:3.96

唾液腺:4.15

CAGE

子宮:1.07

胎盤:1.53

前立腺:2.46

卵巣:0.37

精巣:2.48

心臓:7.88

骨格筋:9.50

食道:5.01

胃:-

腸:0

結腸:0.38

肝臓:0

肺:3.74

膀胱:2.23

腎臓:1.92

下垂体:1.78

甲状腺:4.02

副腎:-

膵臓:0

乳腺:0

唾液腺:4.00

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:1.58

卵巣:1.10

精巣:6.18

心臓:10.94

骨格筋:9.86

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.86

肝臓:0.35

肺:4.89

膀胱:-

腎臓:2.90

下垂体:-

甲状腺:8.65

副腎:1.52

膵臓:-

乳腺:6.44

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_003280
Gene ID	7134
Unigene ID	Hs.118845
Probe set ID	209904_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000114854
GTEx ID	ENSG00000114854

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_009393
ラット[1]	NM_001034105

染色体

3p21.1 [52,485,118 - 52,488,086]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR002048	Calcium-binding EF-hand
IPR018249	EF-HAND 2
IPR001125	Recoverin

GO:0060048	cardiac muscle contraction
GO:0030049	muscle filament sliding
GO:0043462	regulation of ATPase activity
GO:0006937	regulation of muscle contraction
GO:0032972	regulation of muscle filament sliding speed
GO:0055010	ventricular cardiac muscle tissue morphogenesis

GO:0005829	cytosol
GO:0005861	troponin complex

GO:0051015	actin filament binding
GO:0005509	calcium ion binding
GO:0048306	calcium-dependent protein binding
GO:0005515	protein binding
GO:0042803	protein homodimerization activity
GO:0031013	troponin I binding
GO:0031014	troponin T binding

troponin C type 1 (slow)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function