tenascin XB

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同義遺伝子名

XB, TENX, TNX, Hexabrachion-like protein, TN-X, tenascin XB, TNXBS, HXBL, Tenascin-X precursor, TNXB, TNXB1, TNXB2, XBS

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:14.20 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:92 脊柱:112.30 網膜:- 目:58.80 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:56.70 胸腺:- 骨髄:59 脂肪:161.30 骨:102.40 皮膚:4.80
GeneChip 大脳:4.44 小脳:4.63 脳幹:4.57 脳梁:4.44 松果体:- 末梢神経:4.86 脊柱:4.34 網膜:- 目:- 動脈:5.24 静脈:4.99 リンパ節:4.41 末梢血:- 脾臓:4.11 胸腺:4.24 骨髄:4.60 脂肪:5.76 骨:- 皮膚:5.05
CAGE 大脳:2.01 小脳:- 脳幹:2.51 脳梁:2.17 松果体:2.71 末梢神経:- 脊柱:3.21 網膜:- 目:- 動脈:5.33 静脈:5.57 リンパ節:3.76 末梢血:- 脾臓:3.77 胸腺:1.85 骨髄:- 脂肪:5.67 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:36.50 胎盤:21.90 前立腺:78.90 卵巣:186.30 精巣:21.60 心臓:38.30 骨格筋:60.30 食道:- 胃:21.20 腸:97.20 結腸:84.80     肝臓:-        肺:97.80    膀胱:- 腎臓:10.40 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:609.40 膵臓:8.90 乳腺:18.60 唾液腺:-
GeneChip 子宮:5.02 胎盤:4.36 前立腺:4.14 卵巣:4.95 精巣:4.40 心臓:5.11 骨格筋:5.14 食道:5.06 胃:4.76 腸:5.04 結腸:5.08 肝臓:4.48 肺:4.85 膀胱:- 腎臓:4.51 下垂体:4.33 甲状腺:4.34 副腎:5.06 膵臓:4.64 乳腺:4.61 唾液腺:4.63
CAGE 子宮:5.34 胎盤:3.86 前立腺:4.16 卵巣:5.55 精巣:3.73 心臓:5.86 骨格筋:4.58 食道:5.10 胃:- 腸:4.18 結腸:5.10     肝臓:2.88    肺:4.99 膀胱:5.34 腎臓:2.64 下垂体:2.08 甲状腺:3.72 副腎:- 膵臓:2.60 乳腺:5.96 唾液腺:2.99
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0 卵巣:0 精巣:0 心臓:0 骨格筋:0 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0     肝臓:0        肺:0    膀胱:- 腎臓:0 下垂体:- 甲状腺:0 副腎:0 膵臓:- 乳腺:0 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_032470
Gene ID 7148
Unigene ID Hs.485104
Probe set ID 216339_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000168477
GTEx ID ENSG00000168477

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_031176
ラット[1]  NM_031176

染色体

HSCHR6_MHC_APD  [32,052,787  -  32,065,237]
HSCHR6_MHC_COX  [31,957,379  -  32,033,845]
HSCHR6_MHC_QBL  [31,966,588  -  32,011,521]
6p21.33  [32,008,931  -  32,083,111]
HSCHR6_MHC_DBB  [31,984,751  -  32,061,164]
HSCHR6_MHC_MANN  [32,072,022  -  32,105,429]
HSCHR6_MHC_SSTO  [32,000,781  -  32,027,628]
HSCHR6_MHC_MCF  [32,085,376  -  32,161,818]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000742  EGF-like, type 3
IPR003961  Fibronectin, type III
IPR008957  Fibronectin, type III-like fold

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1373808
2475872
7686164
8530023
8923003
9278449
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10207042
10343159
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15342556
15455729
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16335952
16567571
17033827
17192952
17202312
17263730
17453911
18058064
18091320
18155129
18335242
18391951
18588874
18679583
19116923
19143814
19143821
19198610
19204726
19266077
19738457
19851445
19860791
19913121
20041166
20301456
20587610
20628086
20853426
21317684
21408207
21829377
22588153
22694956
22827484
22991340
23028341
23284009
23620400
23886662

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0030036  actin cytoskeleton organization
GO:0007155  cell adhesion
GO:0016337  cell-cell adhesion
GO:0007160  cell-matrix adhesion
GO:0030199  collagen fibril organization
GO:0032963  collagen metabolic process
GO:0048251  elastic fiber assembly
GO:0006631  fatty acid metabolic process
GO:0043206  fibril organization
GO:0043506  regulation of JUN kinase activity
GO:0006641  triglyceride metabolic process

Cellular Component

GO:0031012  extracellular matrix
GO:0005615  extracellular space
GO:0005583  fibrillar collagen
GO:0005622  intracellular
GO:0005578  proteinaceous extracellular matrix

Molecular Function

GO:0005518  collagen binding
GO:0008201  heparin binding
GO:0005178  integrin binding