triple functional domain (PTPRF interacting)

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同義遺伝子名

TRIO, Triple functional domain protein, triple functional domain (PTPRF interacting), PTPRF-interacting protein, tgat

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:109 小脳:63 脳幹:- 脳梁:29.20 松果体:- 末梢神経:276 脊柱:112.30 網膜:474.60 目:193.90 動脈:60 静脈:66.60 リンパ節:212.30 末梢血:54.70 脾臓:94.50 胸腺:12.90 骨髄:255.80 脂肪:- 骨:51.20 皮膚:211.20
GeneChip 大脳:6.33 小脳:7.18 脳幹:6.09 脳梁:6.13 松果体:- 末梢神経:6.42 脊柱:6 網膜:- 目:- 動脈:6.69 静脈:6.78 リンパ節:6.33 末梢血:- 脾臓:7.02 胸腺:6.35 骨髄:5.64 脂肪:6.84 骨:- 皮膚:6.26
CAGE 大脳:3.95 小脳:- 脳幹:3.34 脳梁:3.39 松果体:2.90 末梢神経:- 脊柱:3.61 網膜:- 目:- 動脈:4.21 静脈:3.68 リンパ節:2.72 末梢血:- 脾臓:3.49 胸腺:2.82 骨髄:- 脂肪:3.60 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.53 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.03 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.65 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:63.80 胎盤:222.20 前立腺:101.40 卵巣:111.80 精巣:77.90 心臓:102.20 骨格筋:- 食道:- 胃:169.90 腸:32.40 結腸:381.60     肝臓:559.40        肺:68.40    膀胱:- 腎臓:145.60 下垂体:347.90 甲状腺:- 副腎:101.60 膵臓:186.70 乳腺:464.60 唾液腺:-
GeneChip 子宮:7.16 胎盤:6.76 前立腺:6.78 卵巣:6.99 精巣:6.37 心臓:6.46 骨格筋:6.95 食道:6.22 胃:6.37 腸:6.53 結腸:6.46 肝臓:5.82 肺:6.75 膀胱:- 腎臓:5.85 下垂体:6.57 甲状腺:6.10 副腎:6.53 膵臓:5.19 乳腺:7.13 唾液腺:5.45
CAGE 子宮:3.60 胎盤:3.05 前立腺:3.38 卵巣:3.61 精巣:3.47 心臓:3.34 骨格筋:3.12 食道:2.95 胃:- 腸:2.82 結腸:3.86     肝臓:2.48    肺:3.74 膀胱:3.50 腎臓:2.87 下垂体:3.86 甲状腺:2.73 副腎:- 膵臓:2.86 乳腺:3.95 唾液腺:2.06
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:2.50 卵巣:2.91 精巣:2.46 心臓:2.13 骨格筋:1.57 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.14     肝臓:1.26        肺:2.20    膀胱:- 腎臓:2.01 下垂体:- 甲状腺:2.63 副腎:2.48 膵臓:- 乳腺:2.50 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_007118
Gene ID 7204
Unigene ID Hs.130031
Probe set ID 209012_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000038382
GTEx ID ENSG00000038382

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_001081302
ラット[2]  NM_001081302

染色体

5p15.2  [14,143,811  -  14,532,235]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001849  Pleckstrin homology
IPR000719  Protein kinase, catalytic domain
IPR011009  Protein kinase-like domain
IPR002290  Serine/threonine-protein kinase domain
IPR017442  Serine/threonine-protein kinase-like domain
IPR018159  Spectrin/alpha-actinin
IPR001245  Tyrosine-protein kinase, catalytic domain
IPR020635  Tyrosine-protein kinase, subgroup, catalytic domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8643598
9154137
9790533
10341202
10948190
11146652
11595749
11756498
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12477932
12551902
12787561
14702039
15199069
15215162
15308664
15489334
16033331
16094384
16169070
16752383
17043677
17081983
17391702
17606614
18519826
18936096
19008376
19911011
20083228
20379614
21139048
22238672
22323290
22558309
22696684
22939629
23177739
23776197
24025145
24250222

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007411  axon guidance
GO:0048011  nerve growth factor receptor signaling pathway
GO:0043065  positive regulation of apoptosis
GO:0035023  regulation of Rho protein signal transduction
GO:0051056  regulation of small GTPase mediated signal transduction
GO:0007264  small GTPase mediated signal transduction
GO:0007185  transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase signaling pathway

Cellular Component

GO:0005829  cytosol

Molecular Function

GO:0005524  ATP binding
GO:0005085  guanyl-nucleotide exchange factor activity
GO:0005543  phospholipid binding
GO:0005515  protein binding
GO:0004674  protein serine/threonine kinase activity
GO:0005089  Rho guanyl-nucleotide exchange factor activity