U2 small nuclear RNA auxiliary factor 1

同義遺伝子名

RN, U2 snRNP auxiliary factor small subunit, DKFZp313J1712, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, U2AFBP, U2 auxiliary factor 35 kDa subunit, U2AF35, U2AF1, RNU2AF1, FP793, U2(RNU2) small nuclear RNA auxiliary factor 1, U2 small nuclear RNA auxiliary factor 1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:39.10

小脳:25.20

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:30.70

脊柱:112.30

網膜:118.60

目:88.20

動脈:30

静脈:-

リンパ節:131.40

末梢血:18.20

脾臓:151.30

胸腺:154.60

骨髄:98.40

脂肪:40.30

骨:12.80

皮膚:19.20

GeneChip

大脳:9.28

小脳:9.63

脳幹:9.23

脳梁:9.55

松果体:-

末梢神経:9.37

脊柱:9.36

網膜:-

目:-

動脈:9.67

静脈:9.71

リンパ節:9.60

末梢血:-

脾臓:9.97

胸腺:10.41

骨髄:9.84

脂肪:9.41

骨:-

皮膚:9.68

CAGE

大脳:4.24

小脳:-

脳幹:4.31

脳梁:4.38

松果体:4.13

末梢神経:-

脊柱:4.30

網膜:-

目:-

動脈:4.46

静脈:4.49

リンパ節:4.35

末梢血:-

脾臓:4.45

胸腺:4.74

骨髄:-

脂肪:4.39

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:5.22

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:4.38

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:5.84

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:91.10

胎盤:25.50

前立腺:180.20

卵巣:37.30

精巣:21.60

心臓:76.60

骨格筋:-

食道:-

胃:21.20

腸:-

結腸:76.30

肝臓:31.70

肺:53.80

膀胱:125.60

腎臓:31.20

下垂体:116

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:80

乳腺:74.30

唾液腺:328.40

GeneChip

子宮:9.95

胎盤:9.59

前立腺:9.93

卵巣:10.20

精巣:10.21

心臓:9.19

骨格筋:8.57

食道:9.78

胃:9.65

腸:9.48

結腸:9.73

肝臓:9.28

肺:9.71

膀胱:-

腎臓:9.50

下垂体:9.86

甲状腺:10.09

副腎:9.56

膵臓:9.40

乳腺:9.85

唾液腺:9.38

CAGE

子宮:4.52

胎盤:4.50

前立腺:4.41

卵巣:4.63

精巣:4.57

心臓:4.36

骨格筋:4.45

食道:4.15

胃:-

腸:4.33

結腸:4.35

肝臓:4.19

肺:4.23

膀胱:4.64

腎臓:4.26

下垂体:4.74

甲状腺:4.76

副腎:-

膵臓:4.51

乳腺:4.14

唾液腺:4.57

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:5.04

卵巣:6.06

精巣:5.64

心臓:3.71

骨格筋:4.09

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:5.21

肝臓:4.26

肺:4.56

膀胱:-

腎臓:5.01

下垂体:-

甲状腺:6.69

副腎:6.51

膵臓:-

乳腺:5.16

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_006758
Gene ID	7307
Unigene ID	Hs.365116
Probe set ID	202858_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000160201
GTEx ID	ENSG00000160201

オーソログ対応遺伝子

マウス[4]	NM_001163769, NM_024187
ラット[4]	NM_001163769, NM_024187

染色体

21q22.3 [44,513,066 - 44,527,697]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000504	RNA recognition motif, RNP-1
IPR003954	RNA recognition, domain 1

GO:0010467	gene expression
GO:0031124	mRNA 3'-end processing
GO:0006406	mRNA export from nucleus
GO:0006397	mRNA processing
GO:0000398	nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0008380	RNA splicing
GO:0006369	termination of RNA polymerase II transcription
GO:0006366	transcription from RNA polymerase II promoter

GO:0015030	Cajal body
GO:0071013	catalytic step 2 spliceosome
GO:0016607	nuclear speck
GO:0005730	nucleolus
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus
GO:0005681	spliceosomal complex

GO:0046872	metal ion binding
GO:0000166	nucleotide binding
GO:0005515	protein binding
GO:0003723	RNA binding
GO:0050733	RS domain binding

U2 small nuclear RNA auxiliary factor 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function