Usher syndrome 2A (autosomal recessive, mild)

同義遺伝子名

dJ1111A8.1, USH2, Usher syndrome 2A (autosomal recessive, mild), Usher syndrome type IIa protein, Usherin precursor, Usher syndrome type-2A protein, US2, USH2A

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

nodata

GeneChip

大脳:2.69

小脳:2.71

脳幹:2.71

脳梁:2.58

松果体:-

末梢神経:2.57

脊柱:2.68

網膜:-

目:-

動脈:2.64

静脈:2.62

リンパ節:2.57

末梢血:-

脾臓:2.52

胸腺:2.64

骨髄:2.61

脂肪:2.64

骨:-

皮膚:2.64

CAGE

大脳:0.06

小脳:-

脳幹:0.09

脳梁:0.07

松果体:4.07

末梢神経:-

脊柱:0

網膜:-

目:-

動脈:0

静脈:0

リンパ節:0

末梢血:-

脾臓:0

胸腺:0.06

骨髄:-

脂肪:0

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.00

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

nodata

GeneChip

子宮:2.55

胎盤:2.73

前立腺:2.53

卵巣:2.56

精巣:3

心臓:2.90

骨格筋:2.71

食道:2.52

胃:2.57

腸:2.55

結腸:2.60

肝臓:2.52

肺:2.53

膀胱:-

腎臓:2.60

下垂体:2.73

甲状腺:2.51

副腎:2.58

膵臓:2.65

乳腺:2.55

唾液腺:2.72

CAGE

子宮:0

胎盤:0.08

前立腺:0

卵巣:0

精巣:0.12

心臓:0

骨格筋:0.05

食道:0

胃:-

腸:0

結腸:0.35

肝臓:0

肺:0

膀胱:0

腎臓:0

下垂体:1.60

甲状腺:0

副腎:-

膵臓:0

乳腺:0

唾液腺:0.36

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0

卵巣:0

精巣:0.00

心臓:0.00

骨格筋:0

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0

肝臓:0.00

肺:0

膀胱:-

腎臓:0

下垂体:-

甲状腺:0.00

副腎:0

膵臓:-

乳腺:0

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_007123
Gene ID	7399
Unigene ID	-
Probe set ID	207706_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000042781
GTEx ID	ENSG00000042781

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_021408
ラット[1]	NM_021408

染色体

1q41 [215,796,236 - 216,596,738]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR008985	Concanavalin A-like lectin/glucanase
IPR013320	Concanavalin A-like lectin/glucanase, subgroup
IPR003961	Fibronectin, type III
IPR008957	Fibronectin, type III-like fold
IPR001791	Laminin G

GO:0035315	hair cell differentiation
GO:0060113	inner ear receptor cell differentiation
GO:0048496	maintenance of organ identity
GO:0045494	photoreceptor cell maintenance
GO:0050896	response to stimulus
GO:0050953	sensory perception of light stimulus
GO:0007605	sensory perception of sound
GO:0007601	visual perception

GO:0016324	apical plasma membrane
GO:0005604	basement membrane
GO:0005737	cytoplasm
GO:0016021	integral to membrane
GO:0002142	stereocilia ankle link complex
GO:0032421	stereocilium bundle
GO:0060171	stereocilium membrane

GO:0005518	collagen binding
GO:0017022	myosin binding
GO:0005515	protein binding

Usher syndrome 2A (autosomal recessive, mild)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function