X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 4

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同義遺伝子名

XRCC4, X-ray repair cross-complementing protein 4, DNA-repair protein XRCC4

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:11.90

小脳:12.60

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:92

脊柱:-

網膜:-

目:11.80

動脈:30

静脈:-

リンパ節:40.40

末梢血:18.20

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:39.40

脂肪:-

骨:12.80

皮膚:9.60

GeneChip

大脳:2.80

小脳:2.70

脳幹:2.85

脳梁:2.90

松果体:-

末梢神経:2.93

脊柱:2.88

網膜:-

目:-

動脈:2.91

静脈:2.88

リンパ節:2.88

末梢血:-

脾臓:2.69

胸腺:3.75

骨髄:3.13

脂肪:2.78

骨:-

皮膚:3

CAGE

大脳:1.79

小脳:-

脳幹:1.99

脳梁:1.71

松果体:1.98

末梢神経:-

脊柱:2.06

網膜:-

目:-

動脈:1.33

静脈:1.61

リンパ節:1.49

末梢血:-

脾臓:2.30

胸腺:2.47

骨髄:-

脂肪:1.97

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.87

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.00

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.00

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:21.90

前立腺:-

卵巣:37.30

精巣:47.60

心臓:-

骨格筋:40.20

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:10.60

肺:-

膀胱:-

腎臓:31.20

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:27.90

唾液腺:-

GeneChip

子宮:2.97

胎盤:2.83

前立腺:2.97

卵巣:3

精巣:3.49

心臓:2.82

骨格筋:2.60

食道:2.78

胃:2.77

腸:2.84

結腸:2.64

肝臓:2.78

肺:2.72

膀胱:-

腎臓:2.80

下垂体:2.57

甲状腺:2.83

副腎:2.83

膵臓:2.67

乳腺:2.90

唾液腺:2.74

CAGE

子宮:1.67

胎盤:1.96

前立腺:1.42

卵巣:1.53

精巣:2.01

心臓:1.84

骨格筋:1.14

食道:2.00

胃:-

腸:2.34

結腸:1.33

肝臓:1.41

肺:1.96

膀胱:1.58

腎臓:2.11

下垂体:2.02

甲状腺:1.59

副腎:-

膵臓:0.58

乳腺:1.53

唾液腺:1.39

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.83

卵巣:0.49

精巣:1.65

心臓:0.00

骨格筋:0.62

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.75

肝臓:0.80

肺:0.81

膀胱:-

腎臓:0.00

下垂体:-

甲状腺:0.00

副腎:1.12

膵臓:-

乳腺:1.15

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_003401
Gene ID	7518
Unigene ID	Hs.567359
Probe set ID	205072_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000152422
GTEx ID	ENSG00000152422

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_028012
ラット[1]	NM_001006999

染色体

5q14.2 [82,373,317 - 82,652,548]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0071285	cellular response to lithium ion
GO:0007417	central nervous system development
GO:0051103	DNA ligation during DNA repair
GO:0006281	DNA repair
GO:0006302	double-strand break repair
GO:0006303	double-strand break repair via nonhomologous end joining
GO:0033152	immunoglobulin V(D)J recombination
GO:0001701	in utero embryonic development
GO:0045190	isotype switching
GO:0043524	negative regulation of neuron apoptosis
GO:0048146	positive regulation of fibroblast proliferation
GO:0051351	positive regulation of ligase activity
GO:0050769	positive regulation of neurogenesis
GO:0002328	pro-B cell differentiation
GO:0010332	response to gamma radiation
GO:0010165	response to X-ray
GO:0033077	T cell differentiation in the thymus
GO:0016032	viral reproduction

Cellular Component

GO:0000793	condensed chromosome
GO:0005829	cytosol
GO:0032807	DNA ligase IV complex
GO:0005958	DNA-dependent protein kinase-DNA ligase 4 complex
GO:0070419	nonhomologous end joining complex
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0003677	DNA binding
GO:0016874	ligase activity
GO:0005515	protein binding
GO:0008022	protein C-terminus binding

X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 4

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function