X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 5 (double-strand-break rejoining)

同義遺伝子名

Lupus Ku autoantigen protein p86, Ku80, TLAA, CTC85, ATP-dependent DNA helicase II 80 kDa subunit, Thyroid-lupus autoantigen, Ku86, CTC box-binding factor 85 kDa subunit, CTCBF, Nuclear factor IV, G22P2, KARP1, FLJ39089, 86 kDa subunit of Ku antigen, KARP-1, NFIV, ATP-dependent DNA helicase 2 subunit 2, XRCC5, KU80, KUB2, DNA-repair protein XRCC5

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:276.10

小脳:188.90

脳幹:-

脳梁:233.30

松果体:148.30

末梢神経:337.40

脊柱:-

網膜:355.90

目:193.90

動脈:239.80

静脈:533.20

リンパ節:343.80

末梢血:218.60

脾臓:340.30

胸腺:244.80

骨髄:314.90

脂肪:201.70

骨:115.20

皮膚:292.80

GeneChip

大脳:7.49

小脳:7.34

脳幹:7.66

脳梁:7.77

松果体:-

末梢神経:7.95

脊柱:7.74

網膜:-

目:-

動脈:8.13

静脈:8.23

リンパ節:8.58

末梢血:-

脾臓:8.31

胸腺:9.56

骨髄:9.04

脂肪:8.48

骨:-

皮膚:8.57

CAGE

大脳:5.27

小脳:-

脳幹:5.37

脳梁:5.26

松果体:5.47

末梢神経:-

脊柱:5.26

網膜:-

目:-

動脈:4.84

静脈:5.30

リンパ節:5.37

末梢血:-

脾臓:5.51

胸腺:5.96

骨髄:-

脂肪:5.45

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:6.00

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:5.76

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:6.33

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:200.50

胎盤:182.20

前立腺:135.20

卵巣:186.30

精巣:216.30

心臓:319.30

骨格筋:160.70

食道:-

胃:382.40

腸:129.60

結腸:178.10

肝臓:411.70

肺:195.50

膀胱:502.40

腎臓:93.60

下垂体:232

甲状腺:1473.70

副腎:50.80

膵臓:115.60

乳腺:269.50

唾液腺:-

GeneChip

子宮:8.79

胎盤:8.31

前立腺:8.67

卵巣:8.91

精巣:8.72

心臓:8.03

骨格筋:7.79

食道:8.79

胃:8.19

腸:8.42

結腸:8.21

肝臓:8.23

肺:8.50

膀胱:-

腎臓:7.93

下垂体:7.84

甲状腺:8.36

副腎:8.05

膵臓:8.34

乳腺:8.69

唾液腺:7.91

CAGE

子宮:5.44

胎盤:5.33

前立腺:5.32

卵巣:5.49

精巣:5.27

心臓:5.12

骨格筋:5.43

食道:5.46

胃:-

腸:5.24

結腸:5.00

肝臓:5.42

肺:5.07

膀胱:5.41

腎臓:5.51

下垂体:5.57

甲状腺:5.43

副腎:-

膵臓:4.95

乳腺:4.77

唾液腺:5.13

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:6.42

卵巣:6.62

精巣:6.57

心臓:5.20

骨格筋:6.06

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:6.14

肝臓:5.37

肺:6.07

膀胱:-

腎臓:6.26

下垂体:-

甲状腺:6.77

副腎:6.28

膵臓:-

乳腺:5.72

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_021141
Gene ID	7520
Unigene ID	Hs.388739
Probe set ID	208642_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000079246
GTEx ID	ENSG00000079246

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_009533
ラット [0]

染色体

2q35 [216,972,187 - 217,071,026]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0008283	cell proliferation
GO:0006310	DNA recombination
GO:0006281	DNA repair
GO:0006302	double-strand break repair
GO:0006303	double-strand break repair via nonhomologous end joining
GO:0060218	hemopoietic stem cell differentiation
GO:0045087	innate immune response
GO:0043066	negative regulation of apoptosis
GO:0045892	negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0050769	positive regulation of neurogenesis
GO:0032481	positive regulation of type I interferon production
GO:0000723	telomere maintenance
GO:0006351	transcription, DNA-dependent
GO:0016032	viral reproduction

Cellular Component

GO:0005829	cytosol
GO:0043564	Ku70:Ku80 complex
GO:0070419	nonhomologous end joining complex
GO:0000784	nuclear chromosome, telomeric region
GO:0000783	nuclear telomere cap complex
GO:0005730	nucleolus
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0051575	5'-deoxyribose-5-phosphate lyase activity
GO:0005524	ATP binding
GO:0004003	ATP-dependent DNA helicase activity
GO:0003684	damaged DNA binding
GO:0003677	DNA binding
GO:0044212	DNA regulatory region binding
GO:0003690	double-stranded DNA binding
GO:0003691	double-stranded telomeric DNA binding
GO:0005515	protein binding
GO:0008022	protein C-terminus binding
GO:0042162	telomeric DNA binding
GO:0031625	ubiquitin protein ligase binding

X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 5 (double-strand-break rejoining)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function