collectin sub-family member 11

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同義遺伝子名

COLEC11, MGC3279, collectin sub-family member 11, DKFZp686N1868

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:4.95 小脳:5.38 脳幹:4.94 脳梁:4.68 松果体:- 末梢神経:5.05 脊柱:5.12 網膜:- 目:- 動脈:5.88 静脈:5.75 リンパ節:5.79 末梢血:- 脾臓:5.31 胸腺:5.33 骨髄:4.77 脂肪:5.78 骨:- 皮膚:5.17
CAGE 大脳:0.27 小脳:- 脳幹:0.07 脳梁:0.70 松果体:0.48 末梢神経:- 脊柱:0.30 網膜:- 目:- 動脈:0.79 静脈:0.47 リンパ節:0.52 末梢血:- 脾臓:0.76 胸腺:0.23 骨髄:- 脂肪:0.84 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.00 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.00 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:5.02 胎盤:5.17 前立腺:4.86 卵巣:5.99 精巣:5.92 心臓:6.20 骨格筋:4.93 食道:5.02 胃:5.48 腸:5.80 結腸:5.27 肝臓:7.84 肺:5.03 膀胱:- 腎臓:6.98 下垂体:5.57 甲状腺:6.07 副腎:8.12 膵臓:6.44 乳腺:4.73 唾液腺:5.18
CAGE 子宮:0.19 胎盤:1.25 前立腺:0.81 卵巣:2.10 精巣:1.31 心臓:2.17 骨格筋:0.38 食道:0.57 胃:- 腸:1.33 結腸:0.46     肝臓:4.00    肺:0.21 膀胱:0.64 腎臓:1.21 下垂体:0.92 甲状腺:1.83 副腎:- 膵臓:1.98 乳腺:0.90 唾液腺:0.36
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0 卵巣:0 精巣:0 心臓:0 骨格筋:0 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.03     肝臓:0        肺:0.00    膀胱:- 腎臓:0 下垂体:- 甲状腺:0 副腎:0 膵臓:- 乳腺:0 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_199235
Gene ID 78989
Unigene ID -
Probe set ID 219873_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000118004
GTEx ID ENSG00000118004

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_027866
ラット[1]  NM_027866

染色体

2p25.3  [3,642,426  -  3,692,048]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001304  C-type lectin
IPR016187  C-type lectin fold
IPR016186  C-type lectin-like

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

12477932
12975309
17179669
17207965
19724895
19851296
20198315
20237496
20956340
21258343
21664996
21893516
23220946
23954398
24174618

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0032502  developmental process
GO:0007275  multicellular organismal development

Cellular Component

GO:0005581  collagen
GO:0005576  extracellular region

Molecular Function

GO:0005537  mannose binding