DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 54

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同義遺伝子名

APR-5, DP97, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 54, DEAD box protein 54, ATP-dependent RNA helicase DP97, ATP-dependent RNA helicase DDX54, DDX54, MGC2835

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:41.50 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:30.70 脊柱:112.30 網膜:- 目:111.70 動脈:30 静脈:- リンパ節:161.80 末梢血:72.90 脾臓:37.80 胸腺:- 骨髄:19.70 脂肪:- 骨:38.40 皮膚:24
GeneChip 大脳:6.04 小脳:6.21 脳幹:5.56 脳梁:5.91 松果体:- 末梢神経:5.76 脊柱:5.70 網膜:- 目:- 動脈:6.28 静脈:6.47 リンパ節:6.55 末梢血:- 脾臓:6.48 胸腺:6.24 骨髄:6.25 脂肪:6.21 骨:- 皮膚:6.36
CAGE 大脳:2.96 小脳:- 脳幹:2.77 脳梁:3.04 松果体:2.53 末梢神経:- 脊柱:2.85 網膜:- 目:- 動脈:3.31 静脈:3.43 リンパ節:3.52 末梢血:- 脾臓:3.57 胸腺:3.61 骨髄:- 脂肪:3.36 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.49 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.95 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.64 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:18.20 胎盤:61.90 前立腺:78.90 卵巣:74.50 精巣:30.30 心臓:25.50 骨格筋:100.50 食道:- 胃:- 腸:32.40 結腸:59.40     肝臓:21.10        肺:48.90    膀胱:- 腎臓:72.80 下垂体:- 甲状腺:163.70 副腎:- 膵臓:53.30 乳腺:74.30 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.11 胎盤:6.40 前立腺:5.77 卵巣:6.36 精巣:5.72 心臓:6.06 骨格筋:6.08 食道:6.55 胃:6.13 腸:6.28 結腸:6.35 肝臓:6.34 肺:6.26 膀胱:- 腎臓:6.30 下垂体:5.59 甲状腺:6.72 副腎:6.25 膵臓:6.75 乳腺:6.68 唾液腺:6.37
CAGE 子宮:3.24 胎盤:3.53 前立腺:3.41 卵巣:3.63 精巣:3.12 心臓:3.34 骨格筋:4.22 食道:3.46 胃:- 腸:3.42 結腸:3.50     肝臓:3.70    肺:3.23 膀胱:3.31 腎臓:3.53 下垂体:2.00 甲状腺:3.57 副腎:- 膵臓:3.57 乳腺:3.43 唾液腺:3.19
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:2.74 卵巣:2.63 精巣:2.30 心臓:0.82 骨格筋:3.93 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.18     肝臓:2.20        肺:1.54    膀胱:- 腎臓:2.51 下垂体:- 甲状腺:3.21 副腎:2.89 膵臓:- 乳腺:2.16 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001111322
Gene ID 79039
Unigene ID Hs.506861
Probe set ID 219111_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000123064
GTEx ID ENSG00000123064

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_028041
ラット [0]  

染色体

12q24.13  [113,594,979  -  113,623,284]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR014001  DEAD-like helicase, N-terminal
IPR014021  Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

11790298
12429849
12466272
12477932
15489334
15635413
16260042
17081983
18954305
19946888
19953087
21182205
21832049
21988832
22113938
22586326
22751105
22910411
23000965
23149075
23239230
23602568
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0030520  estrogen receptor signaling pathway
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0016070  RNA metabolic process
GO:0006396  RNA processing
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005730  nucleolus
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0005524  ATP binding
GO:0004004  ATP-dependent RNA helicase activity
GO:0030331  estrogen receptor binding
GO:0005102  receptor binding
GO:0003723  RNA binding
GO:0003714  transcription corepressor activity