HLA-B associated transcript 2

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

HLA-B associated transcript 2, D6S51E, D6S51, BAT2, HLA-B-associated transcript 2, Large proline-rich protein BAT2, DKFZp686D09175

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:69.90 小脳:37.80 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:122.70 脊柱:449.20 網膜:- 目:235.10 動脈:30 静脈:199.90 リンパ節:293.20 末梢血:54.70 脾臓:94.50 胸腺:193.30 骨髄:314.90 脂肪:80.70 骨:102.40 皮膚:52.80
GeneChip 大脳:7.45 小脳:7.60 脳幹:7.25 脳梁:7.49 松果体:- 末梢神経:7.16 脊柱:7.23 網膜:- 目:- 動脈:7.20 静脈:7.25 リンパ節:7.53 末梢血:- 脾臓:7.56 胸腺:7.33 骨髄:7.36 脂肪:7.27 骨:- 皮膚:7.03
CAGE 大脳:4.84 小脳:- 脳幹:4.63 脳梁:4.80 松果体:5.12 末梢神経:- 脊柱:4.59 網膜:- 目:- 動脈:4.65 静脈:4.56 リンパ節:4.43 末梢血:- 脾臓:4.49 胸腺:4.99 骨髄:- 脂肪:4.13 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:100.20 胎盤:29.10 前立腺:67.60 卵巣:186.30 精巣:134.10 心臓:63.90 骨格筋:40.20 食道:- 胃:42.50 腸:32.40 結腸:93.30     肝臓:10.60        肺:53.80    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:26.70 乳腺:158 唾液腺:-
GeneChip 子宮:7.34 胎盤:6.82 前立腺:7.26 卵巣:7.46 精巣:8.76 心臓:7.25 骨格筋:7.19 食道:7.30 胃:7.40 腸:7.06 結腸:7.39 肝臓:7.19 肺:7.31 膀胱:- 腎臓:7.41 下垂体:7.50 甲状腺:7.43 副腎:7.56 膵臓:7.53 乳腺:7.37 唾液腺:7.09
CAGE 子宮:4.59 胎盤:4.02 前立腺:4.51 卵巣:4.84 精巣:5.59 心臓:4.47 骨格筋:4.34 食道:4.41 胃:- 腸:4.02 結腸:4.29     肝臓:4.03    肺:4.18 膀胱:4.42 腎臓:4.20 下垂体:4.60 甲状腺:4.30 副腎:- 膵臓:4.14 乳腺:4.20 唾液腺:3.93
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0 卵巣:0 精巣:0 心臓:0 骨格筋:0 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0     肝臓:0        肺:0    膀胱:- 腎臓:0 下垂体:- 甲状腺:0 副腎:0 膵臓:- 乳腺:0 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_080686
Gene ID 7916
Unigene ID Hs.436093
Probe set ID 208132_x_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000204469
GTEx ID ENSG00000204469

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_001199044, NM_020027
ラット [0]  

染色体

HSCHR6_MHC_COX  [31,575,863  -  31,592,960]
6p21.33  [31,588,450  -  31,605,548]
HSCHR6_MHC_MANN  [31,627,937  -  31,645,035]
HSCHR6_MHC_SSTO  [31,578,395  -  31,595,492]
HSCHR6_MHC_QBL  [31,578,694  -  31,595,788]
HSCHR6_MHC_MCF  [31,664,743  -  31,681,839]
HSCHR6_MHC_DBB  [31,570,625  -  31,587,723]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

2156268
2813433
8499947
8889548
10949724
10987645
11556964
12477932
14574404
14656967
14667819
15077289
15302935
15489334
15752841
15842729
16083285
16116311
16713569
16751776
16964243
17081983
17827388
17975119
18835879
19023099
19039607
19056867
19115949
19116923
19143821
19531213
19615732
19851445
19946888
20020773
20098615
20195357
20205591
20587610
20616199
20626023
21139048
21145461
21903422
21906983
21988832
22267201
22586326
23047821
23079975
23121087
23221128
23307926
23894747
24132900
24332808
24457600
24550385
24639526
24811749
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0005515  protein binding