homeobox containing 1

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同義遺伝子名

homeobox containing 1, FLJ21616, Homeobox-containing protein 1, HMBOX1, HNF1LA, PBHNF

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:9.50 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:118.60 目:35.30 動脈:30 静脈:- リンパ節:40.40 末梢血:18.20 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:59 脂肪:- 骨:- 皮膚:100.80
GeneChip 大脳:8.19 小脳:7.71 脳幹:8.42 脳梁:8.64 松果体:- 末梢神経:8.95 脊柱:8.81 網膜:- 目:- 動脈:8.02 静脈:7.69 リンパ節:8.39 末梢血:- 脾臓:8.74 胸腺:8.98 骨髄:7.91 脂肪:8.06 骨:- 皮膚:7.66
CAGE 大脳:3.87 小脳:- 脳幹:4.12 脳梁:3.97 松果体:3.98 末梢神経:- 脊柱:4.39 網膜:- 目:- 動脈:3.53 静脈:3.72 リンパ節:3.29 末梢血:- 脾臓:3.59 胸腺:3.72 骨髄:- 脂肪:3.76 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.04 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.87 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:1.86 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:25.50 前立腺:33.80 卵巣:745.30 精巣:38.90 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:42.50 腸:- 結腸:42.40     肝臓:10.60        肺:14.70    膀胱:- 腎臓:10.40 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:152.40 膵臓:53.30 乳腺:37.20 唾液腺:-
GeneChip 子宮:8.31 胎盤:7.89 前立腺:7.64 卵巣:8.29 精巣:8.20 心臓:7.98 骨格筋:7.54 食道:7.62 胃:8.22 腸:7.54 結腸:8.12 肝臓:8.15 肺:8.63 膀胱:- 腎臓:8.16 下垂体:8.23 甲状腺:8.35 副腎:9.05 膵臓:7.44 乳腺:8.25 唾液腺:7.81
CAGE 子宮:3.88 胎盤:3.53 前立腺:3.33 卵巣:3.47 精巣:3.55 心臓:3.48 骨格筋:3.04 食道:3.11 胃:- 腸:3.28 結腸:3.02     肝臓:3.13    肺:3.76 膀胱:3.51 腎臓:3.27 下垂体:3.92 甲状腺:3.39 副腎:- 膵臓:2.76 乳腺:3.58 唾液腺:3.56
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.91 卵巣:1.38 精巣:1.91 心臓:1.73 骨格筋:0.41 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.82     肝臓:0.86        肺:1.61    膀胱:- 腎臓:1.26 下垂体:- 甲状腺:1.41 副腎:1.03 膵臓:- 乳腺:1.31 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001135726
Gene ID 79618
Unigene ID Hs.591836
Probe set ID 219269_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000147421
GTEx ID ENSG00000147421

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_177338
ラット[1]  NM_177338

染色体

8p21.1  [28,747,911  -  28,922,281]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001356  Homeobox
IPR009057  Homeodomain-like
IPR012287  Homeodomain-related

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

12477932
14702039
15489334
16751776
16825764
18983639
19471022
19728927
19757162
20182437
20379614
21693764
21706044
21832049
21839858
21988832
22320217
22990118
23251661
23685356
23813958

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0045892  negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0045893  positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0043565  sequence-specific DNA binding
GO:0003700  transcription factor activity