Smad nuclear interacting protein 1

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同義遺伝子名

SNIP1, Smad nuclear interacting protein 1, dJ423B22.2, Smad nuclear-interacting protein 1, RP3-423B22.3, FLJ12553

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:40.30 小脳:25.20 脳幹:- 脳梁:29.20 松果体:- 末梢神経:30.70 脊柱:- 網膜:- 目:29.40 動脈:30 静脈:133.30 リンパ節:91 末梢血:54.70 脾臓:37.80 胸腺:64.40 骨髄:- 脂肪:40.30 骨:12.80 皮膚:14.40
GeneChip 大脳:4.86 小脳:4.97 脳幹:4.82 脳梁:4.91 松果体:- 末梢神経:5.17 脊柱:4.90 網膜:- 目:- 動脈:4.94 静脈:4.88 リンパ節:4.82 末梢血:- 脾臓:5.08 胸腺:5.02 骨髄:5.10 脂肪:5.04 骨:- 皮膚:5.28
CAGE 大脳:2.93 小脳:- 脳幹:2.82 脳梁:2.95 松果体:2.83 末梢神経:- 脊柱:2.70 網膜:- 目:- 動脈:3.02 静脈:2.97 リンパ節:3.03 末梢血:- 脾臓:2.89 胸腺:3.20 骨髄:- 脂肪:2.93 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.37 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.52 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.36 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:72.90 胎盤:18.20 前立腺:11.30 卵巣:- 精巣:21.60 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:25.40     肝臓:42.20        肺:34.20    膀胱:- 腎臓:20.80 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:5.19 胎盤:5.38 前立腺:5.25 卵巣:5.26 精巣:5.54 心臓:4.97 骨格筋:5.22 食道:5.25 胃:5.08 腸:5.17 結腸:5.17 肝臓:4.79 肺:5.04 膀胱:- 腎臓:4.87 下垂体:5.14 甲状腺:4.93 副腎:4.86 膵臓:5.09 乳腺:5.30 唾液腺:4.77
CAGE 子宮:3.22 胎盤:3.08 前立腺:3.15 卵巣:2.99 精巣:3.56 心臓:2.75 骨格筋:2.94 食道:3.04 胃:- 腸:2.77 結腸:3.00     肝臓:2.70    肺:2.69 膀胱:3.12 腎臓:2.72 下垂体:3.23 甲状腺:2.78 副腎:- 膵臓:3.26 乳腺:2.64 唾液腺:2.93
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:2.42 卵巣:3.35 精巣:3.68 心臓:1.91 骨格筋:2.07 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.16     肝臓:1.88        肺:1.85    膀胱:- 腎臓:2.63 下垂体:- 甲状腺:3.10 副腎:3.16 膵臓:- 乳腺:2.83 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_024700
Gene ID 79753
Unigene ID Hs.471951
Probe set ID 219409_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000163877
GTEx ID ENSG00000163877

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_175246
ラット[1]  NM_001014069

染色体

1p34.3  [38,002,142  -  38,019,905]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000253  Forkhead-associated
IPR008984  SMAD/FHA domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10887155
11567019
12097147
12477932
14702039
15231748
15342556
15378006
15489334
15750622
16189514
17081983
17157259
17207965
17260016
18029348
18632581
18794151
19471022
21167768
21693764
22020748
22094256
22279524
22365833
23000965
23932364
24144296
24654937

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007249  I-kappaB kinase/NF-kappaB cascade
GO:0035196  production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0005730  nucleolus
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0005515  protein binding