jumonji domain containing 5

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

jumonji domain containing 5, FLJ13798, JMJD5

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:22.50 小脳:50.40 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:11.80 動脈:60 静脈:- リンパ節:10.10 末梢血:36.40 脾臓:56.70 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:25.60 皮膚:9.60
GeneChip 大脳:5.82 小脳:5.75 脳幹:5.84 脳梁:5.57 松果体:- 末梢神経:5.79 脊柱:5.78 網膜:- 目:- 動脈:5.91 静脈:5.90 リンパ節:5.81 末梢血:- 脾臓:5.62 胸腺:5.83 骨髄:5.73 脂肪:5.78 骨:- 皮膚:5.89
CAGE 大脳:1.95 小脳:- 脳幹:1.67 脳梁:2.06 松果体:1.91 末梢神経:- 脊柱:1.36 網膜:- 目:- 動脈:1.16 静脈:2.09 リンパ節:1.98 末梢血:- 脾臓:1.52 胸腺:2.23 骨髄:- 脂肪:1.54 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.00 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.00 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.00 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:9.10 胎盤:7.30 前立腺:11.30 卵巣:- 精巣:17.30 心臓:12.80 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:162 結腸:-     肝臓:31.70        肺:19.60    膀胱:125.60 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:327.50 副腎:101.60 膵臓:- 乳腺:18.60 唾液腺:-
GeneChip 子宮:5.77 胎盤:5.89 前立腺:5.71 卵巣:5.85 精巣:5.78 心臓:5.66 骨格筋:5.93 食道:5.75 胃:5.65 腸:6.01 結腸:5.97 肝臓:6.88 肺:5.75 膀胱:- 腎臓:5.74 下垂体:5.94 甲状腺:5.76 副腎:5.77 膵臓:6.05 乳腺:5.70 唾液腺:5.74
CAGE 子宮:1.80 胎盤:1.43 前立腺:1.86 卵巣:1.77 精巣:1.58 心臓:1.16 骨格筋:1.48 食道:1.23 胃:- 腸:3.27 結腸:2.16     肝臓:4.04    肺:1.25 膀胱:1.24 腎臓:1.30 下垂体:1.95 甲状腺:1.48 副腎:- 膵臓:2.08 乳腺:1.16 唾液腺:1.00
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.00 卵巣:0.00 精巣:0.00 心臓:0.00 骨格筋:0.00 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.00     肝臓:0.00        肺:0.00    膀胱:- 腎臓:0.00 下垂体:- 甲状腺:0.00 副腎:0.00 膵臓:- 乳腺:0.06 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001145348
Gene ID 79831
Unigene ID Hs.145717
Probe set ID 220070_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000155666
GTEx ID ENSG00000155666

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_029842
ラット [0]  

染色体

16p12.1  [27,214,807  -  27,233,089]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003347  Transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8125298
12477932
14702039
16189514
16344560
16858412
17909537
20457893
21115819
22375008
22851697
23251661
23948433
24100311
24250222
24344305

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0000086  G2/M transition of mitotic cell cycle
GO:0070544  histone H3-K36 demethylation
GO:0045893  positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0003682  chromatin binding
GO:0051864  histone demethylase activity (H3-K36 specific)
GO:0046872  metal ion binding
GO:0016702  oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen