cleavage and polyadenylation specific factor 7, 59kDa

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同義遺伝子名

pre-mRNA cleavage factor I, 59 kDa subunit, FLJ39024, FLJ12529, MGC9315

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:118.50 小脳:327.40 脳幹:- 脳梁:116.60 松果体:148.30 末梢神経:- 脊柱:112.30 網膜:- 目:41.10 動脈:30 静脈:66.60 リンパ節:50.60 末梢血:36.40 脾臓:37.80 胸腺:180.40 骨髄:137.80 脂肪:- 骨:76.80 皮膚:57.60
GeneChip 大脳:7.71 小脳:7.56 脳幹:7.61 脳梁:7.91 松果体:- 末梢神経:7.65 脊柱:7.72 網膜:- 目:- 動脈:7.91 静脈:7.31 リンパ節:8.19 末梢血:- 脾臓:8.34 胸腺:8.33 骨髄:7.88 脂肪:7.81 骨:- 皮膚:7.93
CAGE 大脳:3.77 小脳:- 脳幹:3.68 脳梁:3.97 松果体:3.73 末梢神経:- 脊柱:3.57 網膜:- 目:- 動脈:3.74 静脈:3.55 リンパ節:3.68 末梢血:- 脾臓:3.61 胸腺:3.98 骨髄:- 脂肪:3.50 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:4.00 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:3.66 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:3.58 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:118.50 胎盤:87.40 前立腺:78.90 卵巣:74.50 精巣:103.80 心臓:63.90 骨格筋:40.20 食道:- 胃:106.20 腸:- 結腸:118.70     肝臓:42.20        肺:127.10    膀胱:- 腎臓:41.60 下垂体:116 甲状腺:- 副腎:101.60 膵臓:8.90 乳腺:139.40 唾液腺:328.40
GeneChip 子宮:7.97 胎盤:7.85 前立腺:7.93 卵巣:8.05 精巣:8.01 心臓:7.35 骨格筋:7.44 食道:7.75 胃:7.97 腸:7.51 結腸:7.76 肝臓:8.32 肺:7.90 膀胱:- 腎臓:7.91 下垂体:8.59 甲状腺:8.36 副腎:8.13 膵臓:6.69 乳腺:8.14 唾液腺:7.81
CAGE 子宮:3.96 胎盤:3.54 前立腺:3.63 卵巣:3.63 精巣:3.87 心臓:3.26 骨格筋:3.72 食道:3.36 胃:- 腸:3.47 結腸:3.49     肝臓:3.20    肺:3.29 膀胱:3.62 腎臓:3.38 下垂体:4.20 甲状腺:3.48 副腎:- 膵臓:3.20 乳腺:3.30 唾液腺:3.87
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.89 卵巣:4.33 精巣:3.97 心臓:3.01 骨格筋:3.50 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.83     肝臓:2.65        肺:3.58    膀胱:- 腎臓:2.82 下垂体:- 甲状腺:4.18 副腎:4.14 膵臓:- 乳腺:3.52 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001142565
Gene ID 79869
Unigene ID Hs.444552
Probe set ID 217866_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000149532
GTEx ID ENSG00000149532

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_001164272, NM_172302
ラット [0]  

染色体

11q12.2  [61,170,121  -  61,197,503]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000504  RNA recognition motif, RNP-1

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8626397
11060040
12226669
12477932
14702039
15144186
15489334
16055720
16189514
16344560
16713569
17024186
17081983
18729074
18781797
19542561
19596686
19738201
19946888
20467438
20695905
21139048
21890473
21987572
22113938
22174317
22323290
22623428
22939629
23125841
24332808
24457600
24550385
24778252
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0010467  gene expression
GO:0031124  mRNA 3'-end processing
GO:0000398  nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0051262  protein tetramerization
GO:0008380  RNA splicing
GO:0006369  termination of RNA polymerase II transcription
GO:0006366  transcription from RNA polymerase II promoter

Cellular Component

GO:0005849  mRNA cleavage factor complex
GO:0005654  nucleoplasm
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0000166  nucleotide binding
GO:0005515  protein binding
GO:0003723  RNA binding