sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain containing 1

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同義遺伝子名

CCP22, C9orf13, FLJ13529, bA427L11.3, chromosome 9 open reading frame 13, FLJ16013, POLYDOM, SEL-OB, FLJ90719, SVEP1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:23.70 小脳:50.40 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:92 脊柱:112.30 網膜:- 目:41.10 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:75.60 胸腺:25.80 骨髄:- 脂肪:161.30 骨:127.90 皮膚:57.60
GeneChip 大脳:6.29 小脳:7.03 脳幹:6.31 脳梁:6.31 松果体:- 末梢神経:7.03 脊柱:6.26 網膜:- 目:- 動脈:7.47 静脈:7.65 リンパ節:7.33 末梢血:- 脾臓:7.47 胸腺:6.32 骨髄:6.83 脂肪:9 骨:- 皮膚:7.56
CAGE 大脳:1.45 小脳:- 脳幹:1.50 脳梁:1.34 松果体:0.21 末梢神経:- 脊柱:0.46 網膜:- 目:- 動脈:3.24 静脈:2.91 リンパ節:2.37 末梢血:- 脾臓:2.70 胸腺:0.28 骨髄:- 脂肪:4.29 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.63 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:4.81 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:5.71 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:18.20 胎盤:1031 前立腺:22.50 卵巣:- 精巣:34.60 心臓:38.30 骨格筋:20.10 食道:- 胃:- 腸:64.80 結腸:8.50     肝臓:10.60        肺:39.10    膀胱:- 腎臓:62.40 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:50.80 膵臓:17.80 乳腺:83.60 唾液腺:-
GeneChip 子宮:7.83 胎盤:11.57 前立腺:6.28 卵巣:6.97 精巣:5.92 心臓:7.72 骨格筋:6.72 食道:6.93 胃:7.61 腸:7.55 結腸:7.77 肝臓:6.54 肺:8.55 膀胱:- 腎臓:6.64 下垂体:6.18 甲状腺:7.07 副腎:7.24 膵臓:7.11 乳腺:7.88 唾液腺:6.27
CAGE 子宮:3.48 胎盤:6.23 前立腺:2.98 卵巣:2.91 精巣:2.01 心臓:2.76 骨格筋:2.54 食道:3.06 胃:- 腸:2.25 結腸:3.22     肝臓:1.54    肺:3.42 膀胱:3.71 腎臓:1.97 下垂体:0.58 甲状腺:2.58 副腎:- 膵臓:2.34 乳腺:3.92 唾液腺:1.75
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.92 卵巣:2.04 精巣:3.00 心臓:1.96 骨格筋:1.93 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:4.84     肝臓:0.70        肺:3.93    膀胱:- 腎臓:2.14 下垂体:- 甲状腺:2.61 副腎:3.66 膵臓:- 乳腺:3.80 唾液腺:-

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IDs

Refseq ID NM_153366
Gene ID 79987
Unigene ID Hs.522334
Probe set ID 213247_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000165124
GTEx ID ENSG00000165124

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_022814
ラット[1]  NM_022814

染色体

9q31.3  [113,127,531  -  113,342,160]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001881  EGF-like calcium-binding
IPR000742  EGF-like, type 3
IPR000436  Sushi/SCR/CCP

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10737800
11062057
12477932
14702039
15231748
16206243
18029348
18711365
20236627
20361209
20379614
20834067
21556780
22424883
22654117
23386860

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007155  cell adhesion

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0005576  extracellular region
GO:0016020  membrane

Molecular Function

GO:0005509  calcium ion binding
GO:0003682  chromatin binding