sema domain, transmembrane domain (TM), and cytoplasmic domain, (semaphorin) 6D

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同義遺伝子名

SEMA6D, Semaphorin-6D precursor, KIAA1479, FLJ11598

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:59.30 小脳:63 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:184 脊柱:- 網膜:- 目:29.40 動脈:60 静脈:66.60 リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:25.60 皮膚:19.20
GeneChip nodata
CAGE 大脳:3.67 小脳:- 脳幹:3.49 脳梁:3.82 松果体:4.91 末梢神経:- 脊柱:3.61 網膜:- 目:- 動脈:3.11 静脈:1.53 リンパ節:1.30 末梢血:- 脾臓:0.88 胸腺:1.22 骨髄:- 脂肪:2.03 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.55 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.00 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.29 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:9.10 胎盤:36.40 前立腺:- 卵巣:37.30 精巣:4.30 心臓:63.90 骨格筋:20.10 食道:- 胃:- 腸:32.40 結腸:8.50     肝臓:31.70        肺:9.80    膀胱:- 腎臓:20.80 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:88.90 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:2.28 胎盤:3.56 前立腺:2.55 卵巣:3.09 精巣:2.26 心臓:2.36 骨格筋:2.35 食道:1.68 胃:- 腸:4.73 結腸:3.50     肝臓:1.84    肺:2.50 膀胱:1.62 腎臓:3.01 下垂体:2.81 甲状腺:1.80 副腎:- 膵臓:3.40 乳腺:1.92 唾液腺:1.15
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.82 卵巣:2.88 精巣:0.56 心臓:0.86 骨格筋:0.12 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.50     肝臓:0.48        肺:0.33    膀胱:- 腎臓:0.22 下垂体:- 甲状腺:0.70 副腎:0.37 膵臓:- 乳腺:1.12 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_153618
Gene ID 80031
Unigene ID Hs.511265
Probe set ID -
Ensembl ID ENSG00000137872
GTEx ID ENSG00000137872

オーソログ対応遺伝子

マウス[5]  NM_172537, NM_199238, NM_199239, NM_199240, NM_199241
ラット [0]  

染色体

15q21.1  [47,704,587  -  48,066,417]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003659  Plexin/semaphorin/integrin
IPR001627  Semaphorin/CD100 antigen
IPR015943  WD40/YVTN repeat-like-containing domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10819331
11102867
11842242
12110693
12477932
14702039
14977921
16715077
17143962
18029348
19913121
20628086
22911880
23870195

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007411  axon guidance

Cellular Component

GO:0005794  Golgi apparatus
GO:0016021  integral to membrane
GO:0005886  plasma membrane

Molecular Function

GO:0004872  receptor activity
GO:0030215  semaphorin receptor binding