chromodomain helicase DNA binding protein 9

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同義遺伝子名

Chromatin remodeling factor CHROM1, BC022889, AD013, KIAA0308, FLJ12178, CHD9, chromodomain helicase DNA binding protein 9, ATP-dependent helicase CHD9, PPAR-alpha-interacting complex protein 320 kDa, Chromatin-related mesenchymal modulator, KISH2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 9, CHD-9, CReMM, PRIC320, Kismet homolog 2

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:- 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
GeneChip 大脳:7.54 小脳:8.21 脳幹:7.63 脳梁:7.56 松果体:- 末梢神経:7.94 脊柱:7.45 網膜:- 目:- 動脈:7.85 静脈:7 リンパ節:7.68 末梢血:- 脾臓:7.93 胸腺:7.99 骨髄:6.53 脂肪:7.97 骨:- 皮膚:7.89
CAGE 大脳:3.85 小脳:- 脳幹:3.96 脳梁:3.24 松果体:4.04 末梢神経:- 脊柱:4.08 網膜:- 目:- 動脈:3.15 静脈:3.57 リンパ節:3.48 末梢血:- 脾臓:3.72 胸腺:3.90 骨髄:- 脂肪:4.35 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.28 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:2.38 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.23 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:4.90    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:8.24 胎盤:7.02 前立腺:8.52 卵巣:8.31 精巣:6.89 心臓:7.65 骨格筋:7.37 食道:7.65 胃:7.75 腸:7.21 結腸:6.68 肝臓:7.91 肺:7.42 膀胱:- 腎臓:7.80 下垂体:8.51 甲状腺:8.28 副腎:8.32 膵臓:6.12 乳腺:8.19 唾液腺:7.93
CAGE 子宮:4.03 胎盤:3.32 前立腺:3.95 卵巣:3.95 精巣:3.28 心臓:3.45 骨格筋:3.63 食道:3.83 胃:- 腸:3.69 結腸:3.61     肝臓:3.40    肺:3.80 膀胱:3.83 腎臓:3.67 下垂体:4.31 甲状腺:3.49 副腎:- 膵臓:2.94 乳腺:3.81 唾液腺:3.34
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:2.85 卵巣:2.92 精巣:2.38 心臓:2.15 骨格筋:1.89 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.35     肝臓:1.69        肺:2.30    膀胱:- 腎臓:2.91 下垂体:- 甲状腺:2.98 副腎:2.20 膵臓:- 乳腺:2.54 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_025134
Gene ID 80205
Unigene ID Hs.622347
Probe set ID 212616_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000177200
GTEx ID ENSG00000177200

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_177224
ラット[1]  NM_177224

染色体

16q12.2  [53,088,945  -  53,361,413]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000953  Chromo domain
IPR014001  DEAD-like helicase, N-terminal
IPR014021  Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
9205841
10931946
12477932
14702039
16095617
16523501
16554032
16705189
17081983
19471022
20379614
21139048
21693764
23667531
23969696

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0044255  cellular lipid metabolic process
GO:0016568  chromatin modification
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0005654  nucleoplasm

Molecular Function

GO:0005524  ATP binding
GO:0003677  DNA binding
GO:0004386  helicase activity
GO:0005515  protein binding